可以进行b超或者ct引导下穿刺引流脓液，引流的同时，再配合抗生素使用，可以加速脓肿的吸收；腹腔镜下肾脏囊肿去顶减压手术，手术创伤小、恢复快。另外，如果是不能耐受手术治疗的患者可以采用囊肿穿刺抽液治疗。
切除治疗术，早期肾穿刺造瘘鵻，充分引流，若肾功能恢复鵻，则矫治梗若，功能鵻不能恢复，且对侧肾功能良好者，应行患侧肾切除术；抗生素治疗，对于肺脓肿要做到早期，有效和彻底地给予抗生素类的药物的治疗。
中医治疗，注重扶正固本，理气活血，标本兼顾，效果稳定，副作用少；对症治疗，应用碱性类的药物，可降低酸性尿液对膀胱的刺激，抑制平滑肌细胞类的药物，可解除膀胱痉挛和缓解刺激症状。
腹腔镜下肾脏囊肿去顶减压手术，手术创伤小、恢复快，另外，如果是不能耐受手术治疗的患者可以采用囊肿穿刺抽液治疗。中药治疗，中药毒副作用小，能减少对肾脏的损伤，能取得好的治疗效果。
肾脓肿需要去泌尿外科进行药物的对症处理，如果使用了敏感的、高效的药物，可以在一个星期内缓慢的消失，从而得到完全的治愈。
积极治疗一星期以后，抗生素的应用依然没有任何作用，脓肿没有消失，也没有继续扩张，蔓延，会引起发烧，寒战等症状，这是因为保守疗法不管用，需要更换抗生素，还要做B超和CT引导下的抽吸引流，这样才能将脓液从脓腔内排出，并且在初期应用一些抗生素。
