如果是低位单纯肛瘘，到正规医院就诊，由富有经验的肛肠科医生实施手术，术中准确找到感染肛腺，并且予以适当处理，术后几乎不会复发。如果是高位复杂肛瘘，即使到正规医院，由富有经验的肛肠科医生实施手术，仍然有比较高的复发几率。所以，肛瘘术后复发率不能一概而论，要看是低位单纯肛瘘还是高位复杂肛瘘，高位复杂肛瘘术后甚至有50%的复发几率。
目前治疗肛瘘性的疾病主要是采取手术的方法进行治疗，但是根据临床方面的统计，病人在接受了肛瘘手术后是很容易复发的，一般凡是经过肛瘘手术治疗的病人96%以上都会出现复发的现象。也就是说肛瘘手术后复发率高达96%甚至以上。
可以到正规医院肛肠外科就诊，做超声波，肛瘘造影等检查，明确情况，病情的具体情况，手术以及挂线等治疗方法进行综合治疗。是否容易复发需看依瘘管的位置确定。一般治疗效果良好。
肛瘘手术后有复发可能性，需要当地正规综合性医院肛肠科检查明确，必要时肛诊等检查，确诊复发必要时进一步手术治疗。忌辛辣刺激食物，饮食清淡，注意肛门清洁卫生，应用消炎膏，抗生素治疗等医院肛肠科检查明确，必要时进一步手术治疗复发肛瘘。
该病的复发几率是比较高的。肛瘘术后复发概率跟手术过程中是否清除干净内口以及肛瘘有直接关系，以及术后创面愈合情况，是否有假性愈合。治疗可以到正规医院肛肠外科就诊，做超声波，肛瘘造影检查，明确情况后行手术以及挂线治疗方法进行综合治疗。