肛瘘是小手术，术后应注意随时监测体温，保持肛门清洁，避免感染，结合大夫指示给予肛门栓剂，或每日用药物清洗肛门。术后第一次排便时，病员会感到疼痛和不可忍受，这是正常现象。这段时间饮食清淡，多喝水，多吃新鲜蔬菜水果，如果有咸惯性便秘，需要用药进行调理。
复杂性肛瘘在肛肠科中属于大手术，其手术难度常见原因如下，复杂性肛瘘内、外口较多，且不易找到，往往需借助影像学检查，如盆腔磁共振、腔内B超确定位置，肛门直肠位置狭小，手术器械操作困难，手术耗时长，为保护肛门直肠环境，手术往往需进行两个多小时。
对于肛门直肠手术，痔疮和肛瘘手术是相对较小的手术。在目前的四级手术标准中，这种手术最多是一级或二级手术标准，创伤小，时间短。这是一种小手术，术后恢复快，更容易获得满意的结果。术后注意会阴卫生、饮食和日常排便习惯可以有效预防痔疮和肛瘘的发生。尽量少吃辛辣食物，避免饮酒，每天进行适当的锻炼，养成良好的生活习惯。
肛门萎缩本身就是一个小手术，建议是选择正规的肛肠专科医院手术，不可轻信广告或偏方等，肛瘘一般是肛周脓肿演变而来，有内口和外口，内口位置不同手术方式也不同，术后要积极抗感染，保持肛门部卫生，建议及早发现并加以处理，否则会引起病情的复发和加重。
吃三到五天，起到一个预防感染的作用，平时注意做好清洁护理。术后至少坐浴一个月，一定要采用坐姿坐浴，千万不能用普通的盆放在地上蹲在里面坐浴，否则伤口可能撕裂。手术后坐下的时候一定要架空肛门部位，避免压迫造成的疼痛和水肿。肛肠康复包里面有可以放在马桶上坐浴的肛部水疗器，以及可以架空肛门的无痛透气垫。