肛周囊肿的症状还是比较明显的，首先局部会出现红肿并伴有发热现象，常为低热，有的时候可出现高热，病者还会有整个身躯倦怠不适，食欲不振，睡眠欠佳等。疼痛是常见的肛周脓肿的早期症状，为逐渐加重的持续不间断性肿痛或跳痛。多数需通过手术治疗。
肛周囊肿开始时先感到肛门部出现一个小硬块，坠胀疼痛，肛门部难受，继则出现红肿，局部皮肤发烫，疼痛加重，全身可出现倦怠不适、食欲不振、坐卧不安、夜寐不宁的体温升高等症状。深部脓肿还会引起会阴部和尾骶部胀痛，出现恶寒发热全身中毒症状。
肛周脓肿最主要的症状是疼痛，疼痛剧烈，且逐渐加重。脓肿自行溃破后，疼痛暂时有所缓解。低位脓肿出现剧烈肛门疼痛。其他症状：部分出现大小便不畅、纳差、失眠。诊断依据：肛门周围出现小硬块或肿块，继而疼痛加剧、红肿发热、坠胀不适、坐卧。
对于肛周脓肿需要手术治疗才可以恢复。如果局部红肿消失，没有隆起，手术切口或破溃口完全愈合，无窦道形成，无发烧的情况，则提示可能已经有好转了。多吃新鲜蔬菜和水果，不吃辛辣食物，忌烟酒。
这种病疼痛较重，有的甚至不敢行走或坐着，一般肛周会摸到硬块，肛周皮肤红肿，压痛明显。一般首选抗炎治疗，若抗炎治疗效果欠佳则建议行脓肿切开引流术，术后继续抗炎治疗，及时换药。有时脓肿还会自行破溃而形成肛瘘。
肛周囊肿发生于皮下，属于一种良性疾病。主要的表现就是局部的包块，如果包块逐渐增大，病人也会有疼痛的症状；另外就是继发感染，会出现发热。查体可以发现肛周皮肤局部隆起，可以触及到表面光滑的病变，有轻度的触痛，最有效的治疗手段是选择手术，可以在局部麻醉下将病变进行切除。术中注意避免囊肿破裂而导致术后复发。