肛瘘的治疗方法普通的有两种，挂线术和切除，挂线术就挺好，创伤小，恢复时间也快，费用没有一样的。术后最主要的就是保持切口部位的干净，不能吃辛辣刺激性食物，不能喝酒，大概彻底愈合在1个月左右，只有越干净，最后复发的几率就越小。
肛瘘的手术价格要根据肛瘘复杂程度，高位肛瘘还是低位肛瘘来确定，费用在4000元-20000万左右。
对于低肛瘘，如果患者选择门诊手术和局部麻醉，费用要低得多，如果是单纯的肛瘘，二级医院的手术费用约4000元，三级医院的手术费用约为8000元。如果是复杂的肛瘘，二级医院的费用在6000元以上，三级医院的费用在10000元以上。如果是高复杂性肛瘘，费用会更高，可能在2万元左右。包括术前相关检查费用、手术费用、床位费用、护理费用、换药费用等。
肛瘘手术的费用目前无统一标准，与肛瘘复杂程度、手术方式、手术材料、所在地区、医院等有关。单纯性肛瘘可门诊治疗，治疗费用大概在几百左右；复杂性肛瘘需住院治疗，且住院时间较长，治疗费用在5千左右；如复杂性肛瘘行微创手术，治疗费用在1万左右。
肛瘘多久能痊愈；手术后按时换药，平时注意卫生，勤清洗，便后清洗，一般需要2-4周可以痊愈。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。避免一直保持同样姿势，坐着工作的人每隔一小时要能走动三、四分钟。
对肛瘘疾病进行微创手术操作，费用会相对比较高一些，大概是6千元-8千元不等。这是因为肛瘘微创手术操作，对患者肛门部位的创伤性比较小，伤口容易愈合，愈合时间也较短，但是手术操作难度相对大一些，所以费用会增高。