肛瘘是挂线或者是瘘管切除治疗。术后正常的愈合均会留下疤痕，不会象正常皮肤那样平整。要保持大便通畅，戒酒戒辛辣，注意护理工作。挂线儿的皮筋儿，一星期左右要去加紧。要是括约肌慢慢松弛切断。
孩子肛瘘手术后一月余放屁有些大便，因为术后肛门松弛有关，注意肛门清洁卫生，便后温开水清洁肛门，适当轻轻按摩肛周，可以当地正规综合性医院肛肠外科肛检看看肛瘘手术后伤口愈合恢复情况，进一步处理较妥。
一般五到七天就可以坐着了，但不要久坐，可架空肛门痔疮疼痛部位，坐着不疼的无痛透气垫。也与原有体质，并发其他疾病、手术损伤、切囗愈合、术后的治疗和处置、营养等情况密切相关，基本上要等伤口愈合后才可以去正常上班，如果伤口不严重，恢复良好，出院后至少两个月才可以正常上班。
一般术后几乎不会复发。如果是高位复杂肛瘘，即使到正规机构，由富有经验的肛肠科医生实施手术，仍然有比较高的复发几率。所以，肛瘘术后复发率不能一概而论，要看是低位单纯肛瘘还是高位复杂肛瘘，高位复杂肛瘘术后甚至有50%的复发几率。
肛瘘挂线手术是目前治疗肛瘘最有效最常用的方法，手术腰麻下进行，手术过程中是感觉不到疼的，手术操作首先将窦道探明，就是将皮筋从窦道外口穿入，内口穿出，然后经肛门打结，勒紧，术后通过皮筋持续性收缩，逐渐将窦道勒豁，然后窦道从里向外愈合。