骨骼肌损伤、剧烈运动、进行性肌萎缩等肌肉病变，均可引起肌酸磷酸激酶升高。遇到肌酸磷酸激酶升高时，可进一步做肌酸磷酸激酶的同功酶检查，同功酶的特异性强，能明确显示病变部位。
肌酸激酶偏高有可能是生理性增高，运动后可导致肌酸激酶明显增高，且运动越剧烈，时间越长，肌酸激酶升高越明显。肌肉注射某些药物，如麻醉药、止痛药、抗生素等，可导致血清肌酸激酶偏高。
磷酸肌酸激酶增高的原因非常多，较常见的是营养不良，营养不良的人最容易出现此症状，乙肝感染的病人和心肌损害、心肌梗死的病人，都会出现磷酸肌酸激酶增高。急性心肌梗死的病人，应该高度重视，应给病人抗血小板、抗凝、调脂治疗，改善病人的微循环。
肌酸激酶偏高有可能是生理性增高，运动后可导致肌酸激酶明显增高，且运动越剧烈，时间越长，肌酸激酶升高越明显。肌肉注射某些药物，可导致血清肌酸激酶偏高。男性肌肉容量比女性大，所以血清肌酸激酶也比女性高。还有就是病理性增高，如心肌梗死、病毒性心肌炎、皮肌炎、肌营养不良等也会使肌酸激酶增高。
儿童肌酸激酶偏高的原因有心肌损害，因为心肌里面含有肌酸激酶的量较多，所以患有心肌炎的人也常出现肌酸激酶的偏高，乙肝患者出现肌酸激酶偏高有可能是病毒性肝炎引起的。
肌酸磷酸激酶偏高，最多见的就是肌肉性疾病，比如进行性肌营养不良、重症肌无力，也可以见于癫痫发作后、剧烈运动后，当然急性心肌梗死的患者中肌酸磷酸激酶也会偏高，所以出现肌酸磷酸激酶偏高的现象时候，需要具体原因具体分析。