正常的话没有不良反应，极个别的婴儿可能会有皮疹、腹泻等，通常无需治疗，1一2天以后即可恢复。个别宝宝如果之前已经有腹泻或者有感冒等症状时，可能会造成严重腹泻。
常注射疫苗几天后上述反应可自然消失，不会造成不可逆的伤害。临床常见不良反应包括以下方面：
1、注射小儿麻痹灭活疫苗：注射部位会有疼痛、红斑、硬结、一过性发烧等副作用，少数人在注射后会有淋巴结肿大、兴奋、嗜睡、抽搐等症状，3日后即可消失。还有一些患者会发生诸如皮肤红肿，乃至休克等的免疫应答；
2、口服小儿麻痹减毒活疫苗：大部分患者没有任何副作用，但在极少数的人群中会出现轻度发热、恶心、呕吐、腹泻、皮疹等。有少量的患者会出现严重的副作用，如发热、急性弛缓性瘫痪等，需要及时就诊。
过敏性休克，指的是接种疫苗后，数分钟或者几小时之内，突然发生面色苍白、血压下降、头晕、头昏、呼吸困难，严重的出现昏厥、紫癜，若不及时抢救，有可能导致死亡。血管神经性水肿，常发生于接种后1-3天，注射部位皮肤出现红肿，皮肤因肿胀而发亮，严重的可扩散到整个上臂。
接种完脊髓灰质炎疫苗之后半个小时之内不要给孩子吃奶。因为现在的脊髓灰质炎疫苗大多数都是口服的，如果说半小时之内吃奶的话可能会影响机体对疫苗的免疫应答。另外的话，一部分孩子会吐奶，过早吃奶可能会吐出一部分疫苗，这样子也会影响疫苗的接种效果。
打完乙肝疫苗在短时间内可能会出现一些发热，出现一些皮疹，出现一些等其他的表现，还有可能会出现一些其他的一皮疹的可能，当然绝大部分的一些乙肝疫苗都不会有任何的表现，都是很安全的。
宝宝打完脊灰疫苗之后可能会有恶心呕吐，发热，身体上出现皮疹或腹泻等反应，如果情况不是特别严重，可以不用治疗，过一段时间就会好。但是如果宝宝的反应很强烈，需要在医生指导下使用药物治疗。