病情进展比较迅猛，会出现脑炎，脑干脑炎，肺水肿，循环障碍等。主要是针对神经系统颅内高压的治疗，呼吸及循环衰竭的治疗，不积极治疗，会有生命危险，或者是遗留有后遗症的可能。
重型肝炎很难解决，一般重型肝炎常伴有出血、感染、脑水肿、肾功能衰竭和电解质紊乱。基本治疗应卧床休息，以防止交叉感染和继发性感染。抗病毒药物的使用，免疫调节剂、同时用一些活性微循环药物治疗，可取得一定的疗效。
手足口病的治疗原则主要为对症治疗。可服用抗病毒药物及清热解毒中草药及维生素B、C等。平时应该加强生活护理，做好口腔卫生，勤洗手，进食前后可用生理盐水或温开水漱口，食物以流质及半流质等无刺激性食物为宜。
重症胰腺炎是一种常见的出血坏死性胰腺炎，它会引起腹腔大出血、肠瘘、多脏器功能衰竭，所以病情严重，预后差，死亡率高。
目前对重症胰腺炎，应采取节食、胃肠减压、广谱敏感抗生素、生长抑素等措施，同时还要重视患者的生命体征，特别是肠内营养。其次，要及时清理坏死组织，疏通引流，需要开腹手术、腹腔镜、内镜等手术，如果需要，可以打开腹腔切口，随时进行治疗。如果出现呼吸衰竭或者肾衰竭，可以进行气管插管辅助呼吸、透析治疗。
严重感染肺炎，可以在医院接受非侵入性或非侵入性机械通气。以提高通气功能，加快病情的康复。还可以服用一些抗炎的药物。如果用经验选择的抗生素不能达到预期的效果，可以进行痰培养和药物敏感性实验，根据敏感性试验的结果，选用敏感的抗炎药物。这对于治疗这种疾病来说也是至关重要的。如果出现呼吸急促、发绀等严重的缺氧症状，建议进行吸氧。
通常情况下，肠道病毒侵入血液，会导致手足口病的呕吐。一般的手足口病患者可以根据症状进行治疗，在呕吐后4个小时之内不能进食，可以少量饮水。
如果患者出现严重的呕吐症状时，需要及时补充水分，避免出现低钾、低氯性酸中毒。出现嗜睡、头痛、抽搐等神经系统症状，提示病情比较严重，这时候不仅要补充液体，还要降低颅内高压，对症止惊，同时还要使用丙种球蛋白来抑制急性炎症反应。