子宫内膜异位症的治疗方案，因病情的轻重，年龄和生育情况而有所不同。如果发病时间不久，患妇科检查很少的病变，可以定期到医生处复查，不必治疗。如果病人已婚而未育，可鼓励其受孕，经过一次足月妊娠，可能使病变缓解，甚至完全消失。如病情较重，或表现为重的痛经，或盆腔检查发现有肯定的内膜异位结节，就必须采取药物或手术治疗。
子宫内膜异位是因某种因素，使子宫内膜在身体其他部位生长导致，可采用中药治疗，手术治疗，药物治疗等方法，药物治疗可服用激素类药物，可令异位子宫内膜组织萎缩，从而达到治疗目的。
子宫内膜异位食疗在日常生活种可以多吃含n-3脂肪酸的鱼类，而且有些深海鱼含有11-3脂肪酸，也可以多吃雪菜，这些食物的物质能够有效的抑制前列腺素的产生，是一种天然的抗前列腺素的食物，吃起来更有益。
正常来说可能是吃中药，效果不是特别的明显。但是应该是可以缓解症状，所以这种也可以试一试。但是如果想治疗可能得手术，但是毕竟手术是有创伤的。遵医嘱开药治疗。
子宫内膜异位症是指子宫内膜生长在子宫以外的其他位置，西药治疗通常包括促性腺激素释放激素激动剂，可令异位子宫内膜组织萎缩，从而达到治疗目的。手术治疗切除内膜异位病灶，有的甚至切除子宫、卵巢；适用于药物无效的重症生病的人。
观察治疗：如果较年轻，有生育要求，怀疑子宫内膜异位症，但囊肿非常小，可以先试着怀孕，怀孕本身就是对子宫内膜异位症的治疗，联合治疗：即手术加药物治疗。手术治疗是通过腹腔镜或开腹手术的方式，评估盆腔的状况后，将囊肿或病灶切除，后续需要应用药物治疗，以充分抑制病灶，减少复发。