根据每个病人的具体情况进行个体化的手术治疗。经腹腔镜手术还是开腹手术取决于操作者的经验和技术，不完全取决于疾病期别。子宫内膜异位症手术治疗通常有三种方式，即保留生育功能的手术，保留卵巢功能的手术。
子宫内膜异位征可以保守治疗。宫内膜移位症可以保守治疗。卵巢巧克力囊肿是不可以保守治疗的。先到正规医院，腹腔镜巧克力囊肿取出术。一般采取激素疗法，也可以中西药结合，对于巧囊，一般手术治疗。
子宫内膜异位症治疗方法，首先得看一下子宫内膜异位症异位的部位。如果异位到卵巢位置，形成了卵巢的巧克力囊肿，时候的治疗方法只能是选择手术，如果要是内膜异位到子宫肌层，这就叫做子宫腺肌症，时候的治疗如果有生育要求，可以用一些药物来调理。内膜异位疼痛很明显，痛经很严重，时候有的人没有生育要求，可以考虑切除子宫手术，内膜异位都影响生育，所以子宫内膜异位症的治疗还是以手术治疗为好。
子宫内膜异位保守治疗的费用一般在1-2万元迪，对于子宫内膜异位症需要手术治疗的，热敷，药物，的确是有效果，也且些中医的疗法，但是并不能从根本上解决问题的，而且手术是有一定的风险的，当然也不要轻易的进行手术，关键还是需要看个人的身体状况，确诊后这样才好治疗的，不能忽视这个事情。
子宫内膜异位症有西医手术治疗与中医保守治疗。手术治疗：分保守手术及手术两种。年轻或尚需保留生育机能的女性，可行子宫内膜异位囊肿剥除术及病灶切除术为保守手术；对不要再生育的女性，可行全部子宫及病灶切除，保留一侧或双侧部分卵巢，术后辅以药物治疗，复发率较低；近绝经期的妇女可行手术，行全子宫、双卵巢、输卵管切除术以及病灶切除术可避免复发。
子宫内膜异位症的治疗要根据患者的年龄、病情的严重程度、是否有生育需求来决定，具体的治疗方法有：
1、保守治疗：可以采用假孕术或假绝经治疗，在子宫中用药来控制女性的经期，从而达到假孕或者绝经的目的。
2、外科：现在采用的是微创技术，即腹腔镜，对病变进行全面的综合、根治性和半根治性的治疗，提高患者生存期、生活质量、怀孕率。