巧克力囊肿术后具体的同房时间要根据手术形式而定，经腹腔镜的微创手术，一般在术后两个月就可以同房；如果是做了卵巢子宫全切手术，术后同房时间要延长。按照临床的要求，在术后恢复期间的一个月之内，都是要禁止同房的。
巢囊肿手术后至少也一个月之内是不能同房有性生活，之后要是有性生活那么也要轻一点，这个病是会影响以后的生育的，去医院复查一下刀口愈合情况和卵巢功能恢复的情况，三个月时候到医院复查下看恢复的怎么样。
巧克力囊肿一般是由于慢性炎症或者体内激素水平升高引起的，可以碰凉水，手术一个星期之后就可以着凉。只要是平时避免过于劳累，保持一个良好的心情，不要压力过大，情绪不必过于紧张。
巧克力囊肿复发的时间是不确定的。如果巧克力囊肿的病人术后没有给予相应的干预，绝大多数都会出现复发的情况。主要是因为巧克力囊肿由具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢，才引起的这种囊肿，手术很难把这种活性细胞完全根除掉，所以就会复发。避免复发可以在宫内上节育环。
巧克力囊肿手术之后，建议如果是腹腔镜手术，建议在一个半月之后同房，如果是开腹手术，需要是两个月再有性生活。由于巧克力囊肿具有复发性，所以术后要继续给予用药治疗。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症，内膜异位到了卵巢，每个月卵巢异位灶反复出血引起囊肿，并且引起盆腔粘连。容易导致输卵管粘连，引起不孕症。手术后一般要休息一个月，在术后一个月内要注意休息，禁止性生活，所以一个月以后可以同房。