巧克力囊肿也能够怀孕，只是怀孕几率降低。巧克力囊肿是异位的子宫内膜在卵巢皮质内生长，形成单个或多个囊肿，异位的子宫内膜随卵巢激素变化发生周期性出血，导致周围纤维组织增生、粘连形成。如果巧克力囊肿的周围没有粘连，输卵管通畅，卵巢有排卵，就能够怀孕。如果巧克力囊肿形成的时间较长，囊肿内反复出血，输卵管卵巢周围粘连严重，输卵管伞端粘连包裹，输卵管不通畅，就不能够怀孕。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种表现形式，因为囊肿过大，影响怀孕，或怀孕后引起流产或是早产的可能，同时囊肿也有发生变性的可能，患者先手术再怀孕的，引起重视，可以腹腔镜手术。不过一般还是有怀孕的可能性的，但是如果囊肿的尺寸比较大，需要通过手术进行处理的。手术以后不排除复发的可能性，怀孕以后一般这种症状可能会有所改善，需要依照情况按照门诊医生的医嘱对症处理。另外近期在饮食方面要注意，以清淡为主，禁忌辛辣刺激性食物。
有巧克力囊肿并不意味着无法怀孕。巧克力囊肿又称卵巢子宫内膜异位症囊肿，是引起痛经以及不孕不育的常见因素。如果是比较小的巧克力囊肿，临床症状不典型时可以先尝试怀孕，是有几率成功怀孕的。但是如果巧克力囊肿比较大，或者引起明显的痛经症状时，建议应该先进行手术治疗，同时在术后使用药物才能够提高术后的受孕概率。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病理表现形式，即子宫内膜正常应该在宫腔内，但是有一部分内膜异位到卵巢，所以巧克力囊肿里面都是血液，子宫内膜异位不容易怀孕，囊肿小可以行中医治疗，囊肿大建议行西医治疗。
会有影响。巧克力囊肿是卵巢子宫内膜异位症，卵巢是子宫内膜异位症比较常见的累及部位。子宫内膜异位症的典型表现就是继发性痛经并且渐进性加重，可以导致不孕症，比较大的囊肿需要手术治疗。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，对怀孕影响很大，容易造成不孕。
囊肿堵住卵巢，使得卵巢生卵能力减弱，卵子质量会受到很大影响。另外，如果囊肿堵住输卵管，即便能生出卵子，卵子也无法进入子宫，这同样会造成不孕，卵巢囊肿不但易导致不孕，若长期拖延不治，可能会导致恶性病变。目前，对于良性成熟性畸胎瘤、单纯囊肿、上皮性囊肿以及卵巢冠囊肿等良性妇科肿瘤，腹腔镜手术已经成为首选的手术模式。
