治疗可以选择外用药物以及口服药物。外用药物根据皮损的特点选择不同剂型的外用药物，口服药物可以选择止痒的药物。如果是病人因为经常休息不好、劳累等抵抗力比较差的话也可以配合一些调节免疫力的药物来进行口服。
注意局部卫生，经常用温水洗洗，穿透气好的纯棉内裤，必要时可以看看肛肠科医生给予抗过敏治疗，要尽量避免挠抓，避免出现手部及局部皮肤的感染，日常饮食可以以清淡为主，尤其是辛辣食物、海鲜产品、大葱等一些刺激性大的食物不可以食用，可以多吃富含维生素的蔬菜和水果，增强机体抵抗力。
分析接触的各种物品、用具以及化学品中可能致敏的物质，应加以清除。在用药过程中如见局部出现红斑、瘙痒等可疑过敏性症状时，应立即停药。保持肛门的清洁卫生，勤换内衣裤以免加重病情，要防止腹泻或便秘及其他诱发原因。多吃清淡的食物。
轻微肛门湿疹可以外用疗法原则与接触性皮炎的治疗相同。看皮损情况选用适当剂型和药物。对小范围亚急性湿疹应用糖皮质激素霜剂，及配合焦油类制剂外用效果较好。糖皮质激素的口服或注射不宜使用，激素虽对消炎、止痒及减少渗出的作用较快，但停用后很快复发，长期应用易引起许多不良反应。
使用外用的药膏涂抹治疗。随身衣物要冲洗干净，残余在衣物毛巾中的洗洁精可能刺激皮肤。还要适当的增强运动量，运动能增进血液循环，增强皮肤抵抗力，不要用手抓挠或者是频繁地用纸巾擦拭肛门附近。