主要是切除疣体，再加上抗病毒治疗。尖锐湿疣多通过高频电切、电凝的方式将疣体切除，外涂部分软膏保护创面，预防感染；后续反复发作的话，需要多次切除。再在专业医师指导下，定期注射对症药物来抑制病毒复制，经规范治疗后，一般可以治好。注意治疗期间不要与配偶同房，以免传染。
根据肛门疣病的损害程度不同与形状不同，可分为以下多种类型：巨大型尖锐湿疣，是一种疣状癌的变型，这一类型的尖锐湿疣在临床上比较少见；菜花型尖锐湿疣，菜花型尖锐湿疣在临床上较为常见；角化型尖锐湿疣，多发生在干燥皮肤上，或男性阴茎体、阴茎根或阴囊，女性大阴唇、会阴等部位以及肛周，都容易出现。
在去掉尖锐湿疣疣体后，应戒掉烟，酒。每支香烟能使人体损失约3到5毫克的维生素C，而维生素C是增强免疫力的重要维生素。另外，酒、辣椒、葱蒜、韭菜、生姜、香菜、狗肉、羊肉也是不能吃的。
轻微肛门疣需要治疗。疗期间要注意保持局部卫生，不要进行性生活，每日清洗外阴1～2次，保持外阴清洁干燥，勤换内裤，减少分泌物的刺激，换下的内裤要单独清洗并消毒。另外要注意饮食。
去医院挂肛肠科，这个疾病要重视的疾病，它也是一种传染类的病症，是由人类乳头瘤病毒引起的，多和不洁的性生活有关系，在得病后，一定要及时到医院进行检查和治疗，在治疗期间也要注意饮食的清淡。