生殖器疱疹合并宫颈癌、不孕不育。淋病、非淋菌性尿道炎、梅毒、生殖器疱疹等混合感染，合并播散性疱疹、疱疹性脑膜炎、前列腺炎、直肠炎、盆腔炎、脊髓神经根疾病等一系列并发症。在艾滋病流行的地区，该病还可增加艾滋病病毒感染的危险性。
生殖器疱疹的并发症，主要会引起播散性疱疹，疱疹性脑膜炎，前列腺炎，直肠炎，等一系列疾病的并发症。还会导致一些腰部神经炎，脊柱炎。生殖器疱疹的危害最大的，是可能会引起，尿路系统的疾病，会导致男性不孕症。所以平时要加强锻炼，不要有不洁的性行为，提高自身免疫能力，来抵抗病毒感染。
生殖器疱疹会引起播散性疱疹、疱疹性脑膜炎、脊髓脊神经根病、盆腔炎等一系列并发症。生殖器疱疹病毒与生殖器恶性肿瘤关系密切。有人提出引起生殖器疱疹的Ⅱ型疱疹病毒可能是宫颈癌的潜在致癌因子。
在疱疹早期发病的时候，处会有一些成群的小丘疹，还会时不时地伴有瘙痒或者是灼热的感觉。情况严重的话就会出现溃烂，尽管这些症状在2-3周内会逐渐消退，可是还有复发的可能。
会阴部出现瘙痒症状，多数是属于过敏因素，或者是真菌感染，生殖器疱疹是属于病毒感染，有可能会通过性接触进行感染和传播。淋病也可发生龟头包皮炎，但主要表现为急性化脓性。
生殖器疱疹感染后平均约4～5日后发病，外阴患部先有灼热感，即发生成群丘疹，可为一簇或多簇，继之形成水疱。数日后演变为脓疱，破溃后形成糜烂或浅溃疡，自觉疼痛，最后结痂自愈，病程约2～3周。女性发病于大小阴唇、阴蒂或宫颈处，呈现集簇性分布，先为红色丘疹，可变成小水疮，疱疹半透明，内含黄色液体，抓后极易破溃糜烂，可灼热疼痛，也可能出现继发感染，腹股沟淋巴结肿大，有压痛，但多不化脓。