感染衣原体后，因个体差异较大，给药并没有绝对最好，最快，效果最好，除了普通的非处方药，要充分根据个人情况，在医生的指导下，选用最适合自己的药物。
肺炎衣原体感染，以盐酸多西环素、罗红霉素颗粒、阿奇霉素胶囊、克拉霉素胶囊为第一线治疗。
沙眼衣原体的感染，通常是因四环素类和大环内酯类，能较好地抑制沙眼衣原体，喹诺酮类和青霉素类亦有较好的效果。
衣原体肺炎需服用大环内酯或喹诺酮类抗生素，如果是未成年人，喹诺酮类抗生素不能使用，喹诺酮类抗生素对软骨发育有潜在影响，对儿童成长不利，属儿童类禁药。
衣原体是指一种特殊的病原体，无细胞壁，故不能选用青霉素类抗生素或头孢菌素抗生素。衣原体感染的病程相对延长，需坚持治疗。
衣原体感染吃大环内酯类、红霉素类药物可能较好。
衣原体感染对人体健康会造成一定损害，如果是衣原体感染，可以服用红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等大环内酯类或红霉素类药物，是首选的抗菌药物，阿奇霉素、克拉霉素半衰期短，具有良好的生物活性，临床治疗的效果也较好。
妇科衣原体吃抗感染的药。
妇科衣原体检查时要先进行药敏试验，确定哪些药物比较敏感，才能更好的进行治疗。常见的包括克拉霉素、左氧氟沙星等。如果存在一定的耐药性，一般要在半个月内停止服药，一周后再到医院做检查。不要吃辛辣、刺激性的食物，并且要经常更换内裤。
治疗衣原体感染可以使用阿奇霉素、多西环素、红霉素、氧氟沙星、左氧氟沙星、克拉霉素等药物。
衣原体感染是衣原体引起的感染性疾病，主要包括肺炎衣原体感染和沙眼衣原体感染，患者可能会出现发热、咳嗽咳痰、咽干咽痛等症状，可以在医生指导下使用阿奇霉素、多西环素、红霉素、氧氟沙星、左氧氟沙星、克拉霉素等药物。治疗。