囊肿穿刺由于囊肿部位的不同，价格也不一样，大概在500-2000元左右。
肝囊肿穿刺是目前治疗肝囊肿对身体损伤最小、且有效的治疗，肝囊肿穿刺的价格在800-1500左右，这个价格是根据囊肿的大小来定的。卵巢囊肿是一种会对女性卵巢造成巨大伤害的疾病，检查卵巢囊肿费用一般在几十元到百余元左右，由于穿刺使用的是微创技术，所以手术费用就会低一些，大约需要400-500元。
足部腱鞘囊肿若急性期发红充血、水肿，明显胀胀的字，可穿刺治疗，穿刺后可在囊肿中注入少量药物，具有消炎止痛之功效。另外也可采用切开引流或者保守疗法。通常这类病例局麻即可，门诊可做此手术，手术费用约数十元至100余元。对于没有特殊条件的患者也可以用手压法或者用手掌按压法来处理，都可以达到很好的效果。此为相对较少较简单之运算，无需花费过高的成本。
肾囊肿穿刺后至少要休息半个月左右，肾囊肿穿刺抽液术后，会有一过性的血尿存在，并可能会有一段时间。目前主要是防止继发泌尿系感染。血液是一个良好的天然培养基，很容易滋生细菌。要积极抗炎治疗，做好预防工作，以免发生肾盂肾炎疾病，影响肾脏代谢和功能。
肾囊肿穿刺，如果是个单发的肾囊肿，一般都是门诊手术。穿刺后，一般要求病人24小时平卧休息，但是如果是囊肿是多发的囊肿，这种穿刺一般要求住院治疗，住院穿刺后，一般还要休息三天左右。
穿刺治疗巧克力囊肿属于微创治疗，费用通常需要5千元。导致卵巢囊肿的因素有很多，月经期、宫内手术感染和下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常等都会导致卵巢囊肿。遵医嘱治疗，不要急躁。
穿刺治疗巧克力囊肿，属于微创治疗，费用通常需要几百到几千元，巧克力囊肿病情有轻有重，轻度的巧克力囊肿容易治，重度的巧克力囊肿难治，巧克力囊肿病情较轻，治疗容易，费用自然也就相对会低。