微创无痛的肛瘘治疗方法是通过直肠纤维镜进入到肛门里面，通过监视器，直接对内口进行微创电凝，使肛瘘的内口干结闭合，然后洗干净瘘管里面的脓液，这样以后大便后，粪便里面的细菌和粪水进不到四面的组织里面去，就不会形成感染，疼痛。肛瘘一般可以采取挂线或者是手术治疗，需要采取积极的预防，不要有思想负担，多保重粗纤维食物保持大便通畅。积极的预防，提高身体素质。
肛瘘的主要症状是局部流脓，湿痒及疼痛。初期流脓较多，色黄而稠，粪臭味重。久之，脓液逐渐减少，时有时无，稀淡如水，如果过于疲劳，则脓液增多，可有粪便流出。有时瘘管外口可暂时封闭，但不久病人又会出现发烧、局部肿痛，封闭的外口可再度穿破，待脓液流出后症状才逐渐消失。大概要两周的时间。
效果好，如果有些高位肛瘘只能通过手术治疗，主要目的是保护肛门括约肌的功能，或者注意术后及时换药。应注意保持创面清洁，饮食中多吃新鲜蔬菜和水果，养成定时排便的习惯，避免坐太久，尽量少吃辛辣刺激的食物，防止肛瘘复发。
如果确诊是肛瘘，应该及早进行肛瘘切除术，消除内口，如有分支管道，清除分之瘘道，定期换药。保守治疗效果一般容易复发。禁食辛辣刺激性食物，保持大便通畅及肛周清洁，便后可用花椒水清洗肛周，避免久蹲。
肛瘘病人，有病应尽早手术，只有手术才能治疗肛瘘。肛瘘是肛门周围脓肿的后遗症。肛周脓肿被医生切开引流或自行溃破后，脓腔逐渐萎缩变细而形成了一个管道，就是肛瘘。暴露在肛门外的瘘口叫外口，在肛管直肠内的则称为内口。平时要切实做好肛门护理才能阻止恶化。
高位复杂肛瘘挂线手术效果不错，一般要经过30天才能掉线，肛瘘挂线手术是利用丝线或橡皮筋紧缚，以机械压力或收缩力，钝性缓慢剖开管道，用以治疗肛瘘的一种方法，该疗法简便、经济、不影响肛门功能，具有瘢痕小，引流畅通等优点。
