巧克力囊肿常用的治疗方式就是药物治疗和手术治疗，术后一个月内不要同房，不能吃辛辣刺激性、生冷的食物，不要洗盆浴，穿纯棉透气好的内裤，多注意阴部卫生，精神压力不要太大，多注意休息。
能，巧克力囊肿可以吃海带。中药采用调节内分泌，强增免疫辩证施治的方法，采用“软坚散结、活血化瘀、扶正固本”的治疗原则治疗卵巢囊肿，服药方便，见效快，费用低，愈后基本不复发，达到了治病求本、标本兼治的治疗效果。不开刀治疗卵巢囊肿，在临床上取得了很大的进展，取得了很好的疗效。
中医治疗卵巢巧克力囊肿以疏肝理气，扶正因本，活血化瘀，软坚散结，清热解毒为治疗思路。由于气血是肌体的物质基础，而脏腑为气血生化之源，分管气血的生成、统摄和运行。但中医治疗卵巢巧克力囊肿，并不是所有人都适用，具体还需要根据实际病情来看，因此女性朋友患有卵巢巧克力囊肿，一定不要盲目接受巧克力囊肿的治疗，需要去正规的医院听取专业医师嘱咐在考虑。
如果病人的巧克力囊肿没有别的病变，是可以治好的，大多数采取药物治疗和手术治疗，其中药物治疗，保守治疗复发率相当的高，也可以结合中医，比如吃一些活血化瘀，散结的中药。
巧克力囊肿也能够怀孕，只是怀孕几率降低。巧克力囊肿是异位的子宫内膜在卵巢皮质内生长，形成单个或多个囊肿，异位的子宫内膜随卵巢激素变化发生周期性出血，导致周围纤维组织增生、粘连形成。如果巧克力囊肿的周围没有粘连，输卵管通畅，卵巢有排卵，就能够怀孕。如果巧克力囊肿形成的时间较长，囊肿内反复出血，输卵管卵巢周围粘连严重，输卵管伞端粘连包裹，输卵管不通畅，就不能够怀孕。
巧克力囊肿术吃饭是没有什么影响的，正常饮食就可以了。多吃些水果蔬菜，禁食辛辣，烟酒，油腻过大食物。规律作息，不熬夜。可以多吃蔬菜水果，增强皮肤抵抗力。同时多注意复查。