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症状，结合病史，排除药物过敏和其他感染性疾病以及变态反应性疾病，诊断一般不困难。如果临床不能肯定时，可以进一步进行实验室检查，检查包括病毒分离与鉴定、细胞学检查和血清学方法。其中的病毒分离和鉴定可以确诊。实验室常用的检查方法包括：
1、病毒分离 通常采用组织培养、鉴定、分型加以证实，取材的准确和尽快接种是分离成功的前提。必须在发病1~3天内的病损处用棉拭子在水疱底部取得标本，迅速送往实验室作组织培养和病毒分离，其阳性率可以达到75%~85%。
2、检测病毒包涵体 疱疹病毒感染的快速诊断可以取临床标本在显微镜下寻找病毒包涵体 。
3、免疫细胞化学检查 通常是用皮损细胞涂片，经过特殊的处理后在荧光显微镜下观察并检测抗原，生殖器疱疹病毒感染细胞会看见亮绿色荧光。
4、其他 比如电子显微镜检查病毒的颗粒等。
