牙齿矫正的坏处主要是有可能导致牙槽骨发生吸收，形成人为的牙周病，也可能会产正畸性牙龈炎或者是牙周炎，因为正畸需要移动牙齿及牙根，在移动过程中可能会使周围牙槽骨吸收。
如果牙齿出现排列不齐，一般做牙齿的矫正对身体来说是没有什么危害的。通过牙齿矫正可以矫正牙齿的咬合关系，而且是面容变得更加美丽，对身体来说也没有什么副作用。做牙齿矫正也是越早越好，一般在十二三周岁的时候就可以做牙齿矫正，可能需要一年两年的时间。
矫正牙齿治疗费用通常需要花费2万元到4万元左右，选择国产品牌的托槽需要2万元左右，而进口品牌的托槽需要4万元左右。如果正畸前需要通过拔牙减小牙量，则费用需多花费3千元到7千元左右。具体价格还要结合当地的消费水平。
牙齿矫正的过程中有各种副作用，对口腔卫生不好，牙齿上面粘的托槽周围容易引起牙菌斑滞留，时间久了容易引起牙龈炎。需要好好刷牙，控制牙菌斑。金属托槽也容易会导致口腔粘膜的创伤性溃疡，应该注意必要时使用正畸蜡保护。牙齿矫正的过程中，为了使牙齿移动，在牙齿上面施加外力，如果力量过大会引起牙根的内外吸收。
做牙齿矫正的后遗症有牙齿变松，受到损伤，导致牙髓病，有损伤牙龈，牙齿发黄的现象，正畸的过程中，要三个月进行一次牙周专科检查，防止牙周炎症的发生。做矫正要保持口腔卫生，多漱口，不要吃太硬的食物。
牙齿矫正的后遗症是牙齿松动，牙根吸收，损伤牙槽骨，牙体牙髓病等症状。牙齿矫正的后遗症主要是牙齿松动，在牙齿矫正的危害中，出现牙齿松动是比较普遍的。因为牙齿矫正的过程，牙齿周围的组织也在发生不断的移位、重建。