NGS测序的检测周期在不同实验室之间存在差异吗?
NGS测序的检测周期在不同实验室之间确实存在显著差异,主要受以下因素影响:
测序平台和方法:
Illumina平台:如HiSeq系列,运行时间通常为1 - 3天。
Roche 454平台:运行时间约为10小时。
Ion Torrent平台:运行时间较短,约为2小时。
PacBio平台:运行时间约为4小时。
样本处理和建库:
不同实验室在样本处理和建库的效率上有所不同。例如,基于扩增的建库方法相对简单,而杂交捕获方法则更为复杂,可能导致建库时间延长。
数据分析:
数据分析的复杂性也会影响检测周期。一些实验室可能拥有更高效的自动化分析流程,从而缩短整体检测时间。
实验室流程优化:
实验室的整体流程优化程度对检测周期有显著影响。例如,一些实验室通过优化样本准备、建库和数据分析等环节,能够将检测周期缩短至5 - 7个工作日。
检测范围和通量:
检测范围越广(如全基因组测序),检测周期通常越长。而靶向测序(Targeted Sequencing)由于检测范围较小,周期相对较短。
总结,NGS测序的检测周期在不同实验室之间存在差异,主要受测序平台、样本处理、数据分析和实验室流程优化等因素影响。一般来说,从样本接收至报告出具,NGS检测周期可能在1 - 10天不等。
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杨洁玉
/ 副主任医师卵巢功能障碍,多囊卵巢,子宫腺肌症