男性不育患者就诊时，要做全身和局部检查，目的是找出引起不育的病因，及时治疗。
全身检查包括身高、体重、血压的测定，以及对男性第二性征的观察，如体型、毛发分布(重点为胡须、腋毛、阴毛)、有无乳房女性化、有无嗅觉异常。还要进行各系统的检查，注意发现有无内分泌系统、循环系统、呼吸系统、消化系统、神经系统的异常。凡对生育有可能产生影响的病症均应予以重视。
局部检查主要是对生殖器官的检查。一般患者直立或平卧，医生检查有无生殖器官的异常，包括阴囊是否正常，睾丸的大小、位置和形态，附睾及输精管有无结节或缺如，有无精索静脉曲张，有无鞘膜积液等。必要时应做肛门指诊检查前列腺、精囊。还应检查阴茎有无畸形、包茎、硬结，尿道外口有无异常等等。
通过以上检查，可以发现一些疾病的线索，以便进一步做实验室检查。
睾丸活检是男性不育症的一种重要检测方法，通过睾丸活检观察，能直接估计睾丸的生精功能和生精障碍的程度，以及睾丸合成类固醇激素的能力，估价生育能力并可提供直观资料，对治疗的选择和判断预后也是重要的依据。
睾丸活检可在睾丸体积和血清卵泡刺激素(FSH)水平正常而不能解释的无精子症患者中进行，也可用于怀疑患有睾丸肿瘤时。对于泛化的唯支持细胞综合征或曲细精管透明样变的患者，其病变不易被发现，而其血清FSH水平升高， 故不必要进行睾丸活检。
治疗男性不育症的西药有许多，但应根据不同的适应症选用，不能盲目使用。分类如下：
(1)增强精子活力，延长其生存时间的药物：
精氨酸 是精子代谢过程中所需要的物质，每天口服4克。
三磷酸腺苷 能提供精子细胞代谢过程的能量，增加精子的活力，每日一次，肌注20毫克。
激肽释放酶 激肽在人体的代谢过程中能参与精子的生成，并增强精子的活力。每日一次，口服600IU，或每次40IU肌注，每周3次。
(2)调整和刺激人体生精过程的药物：
克罗米芬 属抗雌激素类药物，适应于血清FSH、LH含量较低或正常的少精子症患者。对血清FSH、LH较高及无精子症患者不适用。
它莫西芬(Taxmoxifen) 亦属抗雌激素类药物，适用于原因不明的不育症、生殖道炎症或精索静脉曲张引起的长期不育患者。
促性腺激素释放激素(LHRH) 适用于特发性少精子症患者。
(3)治疗生殖道感染的药物：
多为抗生素类药物，可依据生殖道感染的病原体类型和部位选择有效的药物。
有一些男性不育症患者的器质性病变，无法通过药物解决，只能采取手术治疗的方法。主要有以下几类：
(1)生殖器畸型或发育异常 常见的有隐睾、尿道狭窄、尿道瘘、尿道下裂、尿道上裂、严重的阴茎硬结症等。
(2)梗阻性无精子症 包括输精管、精囊先天缺如引起的梗阻性无精子症；输精管节段性不发育；输精管医源性损伤或结扎；射精管口先天性狭窄等。
(3)精索静脉曲张 在男性不育症中，精索静脉曲张的发生率高达20%～35%，采用精索内静脉高位结扎治疗，可使部分病人恢复生育能力。
(4)器质性性功能障碍 包括因阴茎严重创伤、骨盆骨折、血管性因素(如静脉瘘)或神经性疾病引起的阳痿，以及一些因器质性病变引起的逆行射精患者。
正确治疗男性不育症的前提是诊断明确和正确。男性不育症在治疗前，应搞清病因，以求对症下药。
要治好男性不育症，需遵守以下几个原则：
(1)改掉不良的生活习惯，增强体质 患者应戒烟、戒酒、忌辛辣之品，生活起居养成良好的规律，加强营养，进行适度的体育锻炼。
(2)夫妇配合 过好适度、有效、和谐的性生活。治疗不育症切忌急躁，夫妇双方应密切配合，坚持测定妻子的排卵期，在排卵期前后适当增加同房次数，增加受孕机会。
(3)遵从医生的指导合理治疗 不育症属难治疾病，切忌道听途说，误服补药。应在专科医生的指导下合理治疗。适宜手术的患者应进行手术治疗，适宜药物治疗的患者应坚持服药。必要时进行人工授精等先进方法。如实在是治疗无望，可按照法律程序办理领养手续。
治疗男性不育症以3个月为一疗程，是根据精子从产生到排出体外约需90 天为依据而确定的。
人的精子发生过程可分为六个期，每个期都有特定的时间和细胞组合，六个期构成一个周期，人的精子发生约需经历四个半周期，由于每一周期历时16天，故人的精子发生过程约为70天。精子发生后还需要在附睾的微环境中完全成熟，不同动物精子在附睾中的运行时间也不同，鸡为2～4天，羊为9～14天，小鼠为8天，人为19～23天。
因此，从精子产生到成熟后被排出体外，约为90天，正好3个月左右。因而，接受药物治疗的患者切莫着急或认为药物无效，坚持服药3个月后才会出现疗效。
治疗免疫性不育的目的，是使体内抗精子抗体的滴度降低，甚至使抗精子抗体消失，从而精卵可正常结合，受孕生子。
西医的治疗方法是使用避孕套，使精子与女方脱离接触，不会产生新的抗精子抗体，原有抗体可逐渐消失。这一过程较为漫长，至少约需半年。另外可配合口服小剂量皮质类固醇激素，抑制免疫反应，如强的松、地塞米松、甲基强的松龙等，一般约需连服3个月以上。
近年来，中医学在治疗免疫性不育方面，经过临床探索和总结，积累了许多经验，显示了一定优势。中医学治疗免疫性不育常用的治疗方法有滋阴补肾法、清热解毒法、活血祛瘀法、利湿化浊法、健脾祛痰法等多种。这些治疗方法以内服药为主，简便易行，没有激素长期使用引起的副作用，安全有效，缩短疗程。所以中医药治疗免疫性不育大有前途，应认真总结提高。
虽然男性不育症原因复杂，种类繁多，但有一些男性不育症是可以预防和避免的。
首先，要积极预防各种危害男性生育力的传染病，如流行性腮腺炎、性传播疾病等。其次，要从青春期开始做好性教育和卫生教育工作，了解男性生殖器官的生理特征和保健措施，对睾丸不明原因的肿大、变硬、凹凸不平、疼痛等应提高警惕，一旦发觉应及时就诊。第三，要加强自我保护意识，尤其应做好职业防护，如经常接触放射性物质的工作人员、高温车间及接触毒物较多的人员，要严格按照操作规定和防护章程作业，切忌疏忽大意；要注意对睾丸等生殖器官的保护，避免长时间骑自行车、泡热水澡，以免睾丸受损；还应戒烟戒酒。第四，应做好婚前检查工作，通过检查可发现发育异常、生殖器官缺陷的病例，从而避免婚后的痛苦。第五，在夫妻生活中要互相配合、互相谅解，否则容易发生阳痿、早泄或射精异常等性功能障碍，严重者引起不育。