“近年来，世界医学正重新重视自然和传统医学，我国医学工作者应抓住这一机遇，通过中西医结合对世界医学做出我们民族的新贡献。”
与西医相比，中医更重视整体，强调“治未病”，其“正虚是疾病的重要内因”的认识比西医早上千年。对中医的研究主要包括中药抗癌的治则，他们采用现代免疫学指标观察扶正中药的疗效。1979年，他与美国同道合作对数种扶正中药水提物的研究结果发表，并在“国际肿瘤免疫学和中医”学术会议上宣读，受到国际肿瘤界的广泛重视。以后他们又对黄芪、女贞子、芦笋等进行
研究，发现黄芪多糖和白细胞介素－2有协同作用，芦笋有效成分能诱导肿瘤细胞凋亡等。通过对辅助应用扶正中药的肿瘤病人的长期随访，证明这些药物对子宫颈癌、乳腺癌和肺癌病人可以提高5～10年的生存期。国外学者把根据扶正祛邪理论制定的重视骨髓和免疫功能恢复的治疗模式称为“中国模式”。在此基础上他们研制出了贞芪扶正胶囊、扶正女贞子素和固元颗粒等。国内其他单位也开展了从茯苓和猪苓中提取多糖、从人参中提取皂甙和多糖、从苡米仁中提取“康莱特”以及中医古方六味地黄的研究工作。
中药抗癌是我国对世界的贡献
从天然药物特别是植物中提取可用于临床癌症治疗的有效成分，多年来一直是学术界关注的研究课题。现有的抗肿瘤药物中，植物来源的药物占有相当重要的地位。目前临床常用的药物有：从长春花中提取和半合成的长春花碱、长春新碱、长春酰胺、长春瑞滨，从红豆杉中提取和半合成的紫杉醇和泰索帝，从三尖杉中提取和半合成的三尖杉碱和高三尖杉碱，从我国特有植物喜树中提取和半合成的羟基喜树碱、CPT－11和拓扑替肯等。从中药雄黄发展出的坤制剂治疗白血病也很有苗头。其他如香菇多糖、猪苓多糖、黄芪多糖、齐墩果酸、雄果酸和人参皂甙等，也证明具有抑制病毒、提高免疫功能或生血的作用。活血化瘀中药对鼻咽癌的放射增敏作用和通过抗凝血减少扩散的可能性，也是医学界关注的研究项目。
由孙院士总负责并于近期完成的“参一胶囊辅助化疗治疗非小细胞肺癌随机双盲对照临床研究”已初步证明，由人参中提取的单一成分人参皂甙Rg3，对3、4期非小细胞肺癌病人在完全缓解率、部分缓解率、稳定率、有效率方面均优于对照组，同时一年生存率也明显高于对照组。孙院士相信，从中药中发展抗癌药物有广阔的前景，它是我国对世界医学做出的贡献之一。
中医药研究的新靶点
“深入开展中医扶正治则的研究是对中医学继承发展的最好途径。”孙燕谈到，中医的治则是从辨证开始的，“证”是一个不能逾越的问题。中医的证多数是疾病发生的病理基础和疾病发展导致的病理生理异常。例如气虚、阴虚的人容易发生肿瘤，同时肿瘤到了一定时期也会导致气虚和阴虚，而阴虚比阳虚、气虚更为深沉难治。西医治疗如放疗、化疗又均可导致或加重阴虚。他认为，从内分泌、免疫学、细胞分子和抑癌基因入手研究，对中医证的认识就可能进一步深入，而通过对气虚、阴虚和气阴两虚的中药治疗，可以认识到这些中药对内分泌、细胞免疫功能、细胞因子及基因调控的作用。
当前肿瘤研究应抓哪些重点？孙院士的思路是：继续筛选对肿瘤有抑制作用的中药，包括对癌细胞增值、癌基因和抑癌基因、免疫细胞、HBV、HPV和HIV病毒等有抑制作用的中药；在辨证论治和细胞免疫、细胞因子、基因水平的基础上，对中医证开展动态研究；通过中药治疗观察对中医证的影响，进一步完善对证的认识，提出新学说；不追求在短期内找到超水平的抗癌新药，扎实开展中药对癌症的辅助治疗，不断提高病人的治愈率和生活质量；深入开展中医同病异治和异病同治的研究，如扶正中药对肿瘤的治疗就是中西医的最好结合点。