1、 病灶处皮肤免疫低：由于盲目的激光，冷冻或多次涂抹药造成局部皮肤深度和大面积反复灼伤导致皮肤抵抗力低下，扼制不住病毒的复制。
2、 湿疣有根：一般药物、激光、冷冻很难将疣根清除干净，尤其是激光、冷冻后容易将疣根扩散，使以前一个根变成两个或多个以上。
3、 医生缺乏耐心、细致和经验：有的湿疣小得几乎肉眼都看不见，有的湿疣长在特别隐蔽的地方，很容易被遗漏，这些都是直接造成死恢复燃，再次复发的原因。
4、 用药不当：用药没有针对性和药量不足，造成体内病毒没有清除干净。
5、 患者体质差：有好多自身有糖尿病、肝病或经常易感冒者，在治疗时没有完整的方案，很容易复发。
6、 再感染：夫妻一方治疗愈了，而另一方是病毒携带者或亚临床感染者，通过接触，导致复发。