艾滋病目前尚无特效的病因疗法。总的治疗原则为抗伺机性感染和肿瘤，杀灭或抑制HIV病毒，增强机体免疫功能。
1 伺机性感染和肿瘤治疗：主要是对肺囊虫肺炎、弓形体病、真菌感染、鸟结构及结核分枝杆菌、隐孢子及同形孢子虫病、卡波氏肉瘤等的对症治疗。
2 抗HIV治疗：目前正式批准用于临床抗HIV病毒的药物仅为五种。它们是：
①AZT（3’-azide-3’-deoxythymidine），叠氮胸甘，商品名Retrovir。1987年由美国FDA批准用于临床。该药属于同功异质体核苷类药物，其作用机理为其3’-三磷酸盐与HIV的逆转录酶发生竞争，导致HIV的DNA合成中止，从而阻断了HIV的复制。为目前抗HIV道选药物，但其骨髓抑制的副作用不可忽视。
②DdI(2,3-dideoxyinosine)，2，3-二脱氧肌苷，商品名Videx，由美国BMS(Bristol-Mayers Squibb)药厂研制开发，FDA于1991年10月批准市场销售。该药可使艾滋病病人病情缓解，有改善CD4细胞数的作用。但不提倡单独使用，而是与AZT合用以减少AZT之用量及副作用。
③Ddc(2,3-dideoxycydine)，23-二脱氧胞苷，商品名Hivid。1992年4月批准使用。该药有较强的降低HIV抗原水平的作用，能改善临床症状，近斯提高CD4细胞水平。但有严重的蓄积毒性，提倡也AZT细胞水平。但有严重的蓄积毒性，提倡与AZT合用，并严格控制其用药量及时间。
④d4T(2,3-didehydro-2,3-dideoxythymidine)，双氢双脱氧胸苷，商品名Zerit，1994年7月批准生产。该药具有较强的抑制HIV活性，且活性部位d4T-TP以三磷酸盐形式存在，不与骨髓细胞结合，故对骨髓造血毒性大大小于AZT。
⑤3TC[(-)2-dideoxy-3-thiacytidine)，双脱氧硫代胞苷，商品名，该药有显著降低HIV活性的作用，有人认为其活性比AZT强20倍，且副作用小。
以上五种药物均属核甙类的双脱氧衍生物，虽有一定疗效，但问题在于不能治愈AIDS病，价格昂贵，有一定的毒副作用和出现耐药变异病毒，且多数仅为短期有效，不能满足长期乃至终身用药的要求。可见，它们都不是理想的药物。因此，研制艾滋病的临床用药尚未从根本上解决。应用天然药物治疗艾滋病，是一个很有前途和价值的研究领域，目前为世界各国所瞩目。