申请一项西药发明专利的目的不应当仅仅是为了获得专利权，而应当是使发明的技术获得有效的保护。申请人为了实现有效的专利保护，应讲究一定的方法和策略。
策略一：产品为先产品的专利保护是绝对保护，一旦产品获得保护，不管采用什么方法制备该产品都落入保护范围之中。因此，当考虑可能获得专利保护的主题时，应当首先考虑产品本身是否能够获得保护。
策略二：范围要大显而易见，保护的范围越大，保护的效力就越强。在保证所要求保护的技术方案具有新颖性、创造性并能够得到说明书实质性支持的前提下，应尽可能要求大的保护范围。比较可行的做法是，在撰写说明书和权利要求书时形成倒塔形层次，即包括一般范围、优选范围、更优选范围和最佳范围。这样既有可能获得宽的保护范围，又保证具有进一步限定保护范围的退路。
策略三：特征求少独立权利要求中记载的技术特征越少，保护的范围越大。因此，为了获得大的保护范围，应当在独立权利要求中只记载必要技术特征。例如，协同药物组合物中活性组分及其之间的配比是必要技术特征，而具体剂型并不是其必要技术特征，不要将剂型的特征写入独立权利要求之中。
策略四：主题得全不同的主题具有不同的保护角度和侧面，可以起到不同的保护作用。应当要求保护所有可能获得专利保护的技术主题，特别是具有单一性的各个主题。例如，一项药物化合物的发明，可以要求保护该化合物本身、化合物的制备方法、含有该化合物的药物组合物以及该化合物在制备药物中的用途。
策略五：例子要多说明书中的实施例是起公开具体实施方案和支持所要求保护范围的作用的，也是申请人所做工作的一种体现，也可能起到以众多列举的方式掩盖关键技术的作用。因此可以说，实施例越多越好，但每个实施例都应当具有一定的代表性。
策略六：国外可去由于专利保护具有地域性并应遵循专利独立原则，一项发明专利申请在我国获得专利权后，只能在我国境内享有专利保护。也就是说，在没有获得专利保护的国家，任何人都可以随意地、毫无限制地使用这项发明。因此，一项发明专利申请的提出应注重市场，不但要考虑国内市场，还应考虑国外市场需求。如果发明者认为其成果在某个国家会有较好的市场前景，就应当去该国申请专利。一般情况下，到国外申请专利有两条途径：一是在一年的优先权期限内直接向某个国家提出专利申请，这适合于仅仅向个别国家提出申请的情况；二是首先在一年的优先权期限内提交国际专利申请指定可能要去申请专利的国家，然后在自优先权日算起的30个月内选定并进入要申请专利的国家。
策略七：后续要跟一项专利的保护力度毕竟是有限的，从保护的范围上来说是有限度的，从保护的时间上来说也是有期限的。因此，在纵向上应当不断有后续改进的申请，如从药物化合物的基本专利到选择一种好的异构体，再到寻找好的盐或晶体。而申请制剂专利也应有后续改进。例如，硝酸甘油舌下片实现了快速产生药效而缓解心绞痛的作用但维持时间短，硝酸甘油注射剂通过连续输注，解决了代谢快的问题，从而实现了维持给药，但使用不便；硝酸甘油贴剂实现了维持给药，并使给药更为方便。此外，在横向上也应当就一个产品进行全方位保护，如应从药物制剂组成到外形，从外包装到产品的标志等多方面通过申请专利保护知识产权。