肛瘘术后可能发生尿潴留，要锻炼排尿功能。手术后要每天换药，按时拆线，保持伤口清洁，避免伤口周围积脓影响恢复，导致伤口感染，不能愈合。尽量每天清洗肛门，更换内裤。手术之后要少活动，多休息。
做了肛瘘术后一定要注意及时清洁，防止分泌物长时间刺激肛周皮肤引起感染，避免肛瘘复发。饮食方面最主要的应该保持清淡，多吃蔬菜水果，多喝水，保持大便通畅，大便以后可以使用溶液清洗。参加多种体育活动能够增强机体的抗病能力，减少疾病发生的可能。
肛瘘手术之后，需要注意肛门周围的卫生，会经常有分泌物，注意不要便秘，不要闹肚子，饮食清淡一些，避免胃肠负担大形成便秘，也不要吃刺激性食物避免导致拉肚子，大便之后用湿巾擦一擦。
肛瘘的主要临床治疗是手术。可以采用挂线疗法或瘘管切开术和瘘管切除术。术后应注意保持排便通畅，防止便秘。应该吃新鲜蔬菜和水果，而不是太辣太油腻的食物，并且需要更多的锻炼来提高身体的免疫力。
肛周脓肿和肛瘘属于开放性的伤口，一般不做缝合，每天换药，坐浴熏洗，就能做到不感染。至于复发，和疾病和做手术有关。应该注意局部清洁卫生。防止伤口受压，尤其在睡觉时避免压倒患处。在手术后2-3天内可以吃一些流食，之后可以进食无渣或少渣的食物等。另外，手术后也就是第五天后应该注意多吃蔬菜、水果。特别注意的是不要进食辛辣刺激的食物，禁烟酒。
早期术后建议以少量的饮食为主，大量饮食或者大便干燥时，都有可能刺激局部伤口而形成刺痛。每天换药前一定要对局部伤口进行清洗，保证局部伤口的干净，可以选择中药洗液、淡盐水进行局部的外洗，预防粪便的残留。