巧克力囊肿术后饮食，没有什么明显的饮食禁忌，对于新鲜的水果、蔬菜、鱼、虾、瘦肉、鸡蛋、牛奶均可以食用。但是对于比较特殊的食物，比如豆制品、豆浆、蜂王浆，尽量减少食用或者是不食用。
避免食用过多油腻的食物，因为脂肪会形成堆积，使伤口不能快速愈合，对细菌的抵抗能力也是会减弱的，所以不要食用太多。不要食用容易胀气的食物，高淀粉类的食物：萝卜、土豆、红薯、芋头、南瓜、板栗等。
术后要注意定期复查，防止巧克力囊肿再次复发。术后用药防止复发，观察盆腔恢复情况。用药正常状态下是三个月不来月经，如果要是来月经，说明用药以后有副作用，然后根据情况对症治疗。术后一个月不能同房，注意消炎，防止粘连，防止感染。
巧克力囊肿术饮食应该一清淡为主，多吃营养丰富的食物，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性、海产品等。要多吃菠菜、牛奶、白菜、瘦肉、黑米、鲫鱼、鸭梨、山药、鸡蛋、大枣、油菜、苹果、花生、香菇等。
术后应注意保暖，平时可以去做一些适度的运动，保持心情愉快，注意休息，饮食上多吃一些有利于消化的食物避免刺激性的食品，还可以选择性的使用一些激素类的药物服用。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症，这种囊肿影响怀孕，并且可以出现经期腹痛，会逐渐加重。如果是大的巧克力囊肿或者影响怀孕，可以做手术治疗。如果是小的巧克力囊肿，没有明显的痛经，也可以用药物治疗。如果有生育要求，要尽快的怀孕，因为子宫内膜异位症是引起不孕证比较重要的原因，所以随着病情的发展，不孕症的发病率会逐渐升高。卵巢巧克力囊肿做手术很容易复发，如果症状不是很严重，暂时可以保守治疗。