一般来说，怀孕三个月肚子右侧隐隐作痛可能是由于子宫增大所导致的。
孕妇在怀孕三个月左右会出现腹部的轻微疼痛，这是生理上的，也有可能是病理性的。如果是由于子宫增大，牵连到一侧的韧带，会产生牵拉性疼痛，需要考虑生理因素。这种症状会随着时间的推移而逐渐消失，不用太过紧张。长期没有好转，可能是肠炎、泌尿系结石、先兆流产、阑尾炎等疾病引起的。
怀孕腰部右侧隐隐作痛，可能存在右侧腰部肌肉痉挛。比如在妊娠3-6个月这个时间段内，由于胎儿快速增长以及羊水量增加，导致腹部的负荷比较大，这样就会使腰部的肌肉长期处于比较紧张的状态。如果采取某种保护性姿势，比如经常向右侧侧卧或者向右侧倾斜坐位，就会使右侧的腰部肌肉产生痉挛，进而引起隐隐的疼痛。
怀孕31周肚子隐隐作痛、腰痛可能是多种原因导致的，具体分析如下：
这是一种正常的生理现象，到了妊娠后期，子宫会越来越大，身体也会发生相应的改变。在妊娠期间需要补充足够的钙，并且由于胎盘分离松弛手术，骨盆韧带、椎间关节、韧带松弛，造成耻骨粘连松弛，或出现腰痛、下腹坠胀等症状。还有一些是宫缩引起的，要仔细观察，如果出现了阵发性宫缩频繁的情况，还要做宫颈管的长度，如果是先兆早产，就要住院保胎。
怀孕中后期会时常出现假性宫缩，这是孕期的正常现象，不必担心。其次，可能是劳累过度，或者活动量比较大引起的症状。再次，如果小腹疼痛没有好转，并且伴有流血现象，考虑就是先兆早产的情况，需要及时的去医院就诊，根据检查结果可以对症治疗。
一般来说，怀孕3个月肚子隐隐作痛可能是以下原因：
怀孕大概有三个阶段，分成怀孕初期、怀孕中后期和怀孕末期，它是卵子与精子结合到囊胚种植子宫内膜的过程。怀孕3个月肚子隐隐作痛，但是没有小腹坠痛，或者是阴道出血，属于正常现象，如果阴道出血，可能是先兆流产，需要积极治疗。
在日常生活中，患者还需适量吃新鲜的水果和蔬菜，保持饮食清淡、营养，适当运动，比如慢跑、游泳等，作息规律。
怀孕2个多月会有腹部疼痛的症状。主要是因为肠胃不好，胃肠道的痉挛，还有一些是怀孕后的正常反应，导致胃疼、恶心、呕吐。
出现腰部疼痛、阴道流血等症状，提示胎儿生长不良，应到正规的医院进行检测，包括人体的人绒毛膜促性腺激素、妇科B超等。怀孕反应可以口服维生素b6片，如胎儿生长不良、有流产征兆，需要立即进行保胎。