妊娠期间甲减对孕妇的作用与甲减的严重程度有关，遗传的甲减会对胎儿的发育造成一定的不良反应，从而造成胎儿的生长发育滞后，甚至有可能造成流产的危险。
亚临床甲减是不是引起怀孕的原因，目前还没有定论，但在怀孕初期出现甲减，特别是临床性甲减，会对胎儿的长期智能产生一定的负面作用。总之，妊娠期间甲减对胎儿的影响，与怀孕期间的甲减有很大关系。
孕妇甲减可以导致胎儿甲状腺发育缺陷，也可造成胎儿死亡，最主要的是造成胎儿甲状腺激素减少。甲状腺激素是维持机体正常生长发育不可缺少的激素，胎儿的甲状腺功能在妊娠第12周开始建立，妊娠前半期胎儿大脑发育所需要的甲状腺激素完全或主要来自母体，孕妇的甲状腺素特别是对胎儿的脑的发育尤为重要。
妊娠期临床甲减可增加不良妊娠结局的风险，如早产、流产、胎盘早剥、低体重儿等，同时，还可影响宝宝的智力发育、神经反应能力及运动能力等。所以怀孕前应治疗甲减，将对胎儿产生的影响减到最低。
孕妇甲状腺功能减退时，可使胎儿中枢神经系统发育障碍，造成智力下降、畸形或早产。因此，为了避免这些不良情况发生，应该加强对甲状腺疾病的重视程度，积极做好相关预防工作。备孕时怀孕时均需要甲状腺功能检查，有甲状腺功能减退者一旦发生，那就应该及时补充甲状腺激素了，使甲状腺功能处于正常的偏上状态，不与药物一味抵触，以免延误治疗，影响胎儿发育。
孕妇甲减会对胎儿先天性发育障碍。
甲减会影响宝宝的智力发育、神经反应能力及运动能力等。这是因为甲状腺是人体重要的内分泌器官，其分泌的甲状腺素参与身体的生长发育和各器官系统的代谢调节，其中，也是胎儿脑神经发育所必须的激素。所以孕妇的甲状腺功能对于胎儿的生长发育影响比较大，因此孕期需要检查甲状腺功能，判断是否在正常范围以内。
孕妇甲减对胎儿影响可以造成胎儿甲状腺激素的减少，特别是对胎儿和新生儿脑的发育尤为重要。严重的甲状腺激素缺乏会造成胎儿的大脑发育障碍，婴儿出生后生长缓慢，称为呆小症。