治疗小三阳一般是要通过口服抗病毒的药物，一般可以达到完全清除的目的。同时还要注意饮食，以免加重肝脏的负担，减少肝脏的抵抗力，同时还要多吃维生素含量比较高的食品，提高人体的免疫力。
乙肝小三阳是指乙肝病毒在肝细胞内处于潜伏期，没有出现大量的复制和繁殖，是要采用抗病毒的药物来进行抗病毒，平时还要采用低脂饮食，高糖饮食，高维生素饮食，以减少肝脏的负担。多做一些户外活动，增强体质，还需要规律睡眠。
小三阳需要治疗，如果肝功能反复异常，病毒量持续升高，肝功能反复异常达到半年时间，可以进行抗病毒治疗，乙肝的治疗很多讲究，前去大型三甲医院或专业的传染病医院进行系统的检查和诊治。如果经护肝治疗后，肝功能好转，恢复正常，无需治疗，只需定期复查腹部彩超、乙肝DNA、乙肝五项、肝功能、甲胎蛋白，如果正常，无需治疗，需注意休息，勿熬夜、劳累、饮酒等。
乙肝小三阳的转阴主要指的是乙肝病毒定量的转阴。乙肝小三阳病情的进展，发生肝硬化、肝癌的危险因素，主要来自于乙肝病毒的复制。所以乙肝小三阳的转阴，首先应该将病毒定量转为阴性，可以选择口服药物，可以在短期内将病毒转阴，肝功能恢复到正常。
乙肝有癌变的几率，但只要肝功能正常就不会癌变，乙肝小三阳指的是表面抗原阳性，e抗体阳性，核心抗体阳性，乙肝小三阳，如果病情得不到较好的控制，会逐渐的出现病情进展，肝炎，肝硬化，甚至发生癌变，形成肝癌。