诊断方法：生殖器疱疹在生殖器上有群簇或散在的小水疱，后破溃形成糜烂或溃疡，自觉疼痛。从皮损处取标本作病毒培养，发现有单纯疱疹病毒和细胞病变。通过聚合酶链反应（PCR）等方法检测HSV-2核酸。
生殖器疱疹的主要症状是生殖器周围有水泡样的疱疹，同时伴有刺痛感，在恢复期可能会有轻度的瘙痒感。如果继发细菌感染，可能会有脓液渗出，生殖器疱疹容易反复发病，可以涂抹药膏治疗。
生殖器疱疹多在发疹前数小时至5天有前驱症状，表现为局部瘙痒症状。生殖器的部位出现许多小水泡，这些小水泡往往会是一簇一簇的，很快破溃形成糜烂或浅表溃疡，生殖器疱会感觉到局部轻微疼痛，瘙痒，烧灼感。
生殖器疱疹是一种传染性极强，复发率极高，临床难治的性传播疾病，虽然是一种顽疾，但并非不治之症。治疗难点在于彻底杀毒，不留后遗症。西药起效比较快，可缓解或改善生殖器疱疹的不适症状。对重度的生殖器疱疹，尤其是反复发作、久治不愈的症状，光吃这些药基本无用。目前通过单纯性服用中药治疗生殖器疱疹较少见，通常仅用于辅助治疗，诸如一些清热解毒的中成药或草药，对临床不适症状的缓解有一定帮助。
生殖器疱疹比较常见的表现为阴部出现一堆约3-4个至5-6个小水疱，基底有些潮红。几天后水疱破溃成为小的麻烂面或浅的溃疡，自觉疼痛不适，不经过治疗可很快愈合，不留疤痕。若疱疹发生在尿道口，那么水疱糜烂感到小便时疼，小便次数增多，尿道口有分泌物。
是由于HSV-2的感染所致，这是生殖器疱疹的主要病原体，约占病因的90%，传染后引起初发生殖器疱疹，初发生殖器疱疹消退后，残存的病毒经周围神经沿神经轴转移至骶神经节而长期潜伏下来。