病毒疣一般不可以自愈。
病毒疣主要是由于局部皮肤受损，机体的免疫力降低，导致人乳头瘤病毒在局部大量增殖引起的，其不可以自愈，因此，其临床的主要目的就是清除疣体，增强机体的抵抗力，延缓疾病的再次发作。目前治疗疣体的主要有：冷冻、点阵激光、光动力治疗等。
病毒疣包括普通疣、扁平疣等可以治愈。
1、普通疣：普通疣是一种人乳头瘤病毒导致的一种皮肤炎症。常见于手及指部，在用药时，可以口服酞丁安软膏、氟尿嘧啶软膏等。
2、扁平疣：扁平疣常见于面部、手背、前手臂等处，一般为一块平坦的丘疹，约有一颗米粒到一颗绿豆，一般也是可以治愈的。
部分病毒疣是可以根除的。
病毒疣通常指人乳头瘤病毒侵袭皮肤黏膜所致。寻常疣为人乳头瘤病毒所致皮肤感染，有自限性，易复发。通常易发生在手上及手指上，扁平疣亦为人乳头瘤病毒在皮肤黏膜上感染所致良性赘生物。此症多出现在面部，手背及前臂，一般为粟粒到绿豆大扁平丘疹，色棕黄或肤色、质坚硬。治疗上，通常建议病人可按医嘱服用维A酸乳膏和氟尿嘧啶软膏进治疗或物理激光进行治疗。
病毒疣不可以自己消失，病毒疣的治疗方法有微波治疗，冷冻治疗，激光治疗，电灼治疗，手术切除等。可以按照自己的意愿选择治疗方法。日常生活中预防病毒疣的措施是非常重要的。
通常病毒疣可以根治。
就寻常疣而言，可以用冰冻、雷射、电离子来进行。出现大范围的皮肤炎症时，可以给予免疫调节剂，例如：干扰素、卡介菌多糖核酸注射液等，还可以服用转移因子胶囊。还有就是传染性软疣，通常只要进行有效的刮疣就可以了，一般可达到较好的治疗效果。