输卵管堵塞的病因有很多种，如盆腔的炎症、妇科的炎症等，炎症会造成输卵管粘膜的损伤，从而形成疤痕，从而引起输卵管的狭窄，或者引起梗阻。此外，经期残留的一些物质，比如从子宫里脱落下来的内膜，就会流入输卵管，造成阻塞，甚至是剖宫产后，如果宫腔内的淤血不能及时排出，就会进入输卵管，造成输卵管阻塞。如果是先天性的输卵管狭窄，那么随着时间的推移，输卵管本身就会出现内膜脱落，从而造成输卵管的阻塞。
双侧输卵管堵塞的原因主要有：输卵管炎症或盆腔腹膜炎症：炎症可以导致输卵管粘膜受到破坏而形成瘢痕，导致出现管腔狭窄、堵塞。子宫内膜异位：由于子宫内膜异位症能够导致输卵管发生周围粘连，而致使输卵管扭曲、伞端闭锁，最终造成输卵管狭窄、堵塞。妇科疾病：致病菌如葡萄球菌、链球菌等，借由阴道、子宫颈以及子宫将疾病感染蔓延到输卵管、盆腔，导致盆腔腹膜炎而致双侧输卵管堵塞。
引起输卵管堵塞的原因主要是炎症感染，主要原因为盆腔炎症，人工流产或者是清宫后导致子宫内膜异位症子宫内膜炎，或者是平时不注意个人卫生，性生活太频繁，性生活不洁也会导致输卵管堵塞粘连，出现输卵管堵塞粘连后可能会有不同程度的腹痛腰痛，月经期明显痛经，分泌物异常，同房性生活时有出血疼痛，最主要的是会影响排卵，影响怀孕。
输卵管堵塞主要是因为病人存在感染和炎症导致。盆腔感染性疾病可造成输卵管的堵塞，常见于衣原体或部分支原体感染等。炎症主要指子宫内膜异位症术后黏连、阑尾炎或腹膜炎等情况均可造成输卵管的堵塞。盆腔感染性疾病病人可出现发热、引导分泌物增多、腹痛等症状，部分衣原体感染时病人可有下腹痛、阴道分泌物稍增多表现。
引起输卵管堵塞的原因有：子宫内膜炎；子宫上部的肌瘤；阴道炎引起：炎滴虫性阴道炎引起的腹膜；心里情绪引起：紧张或情绪上的原因造成的输卵管痉挛；其他疾病引起：淋病、结核和其他原因造成的输卵管、盆腔腹膜的炎症。
下面几种原因都会造成堵塞的：1.阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、卵巢疾病、阑尾炎、结核病的病原菌上行感染。2.人工流产、上环、取环等宫腔操作并发输卵管炎症引起堵塞。3.月经期间行房事，不洁性交、长期阴道出血等人为和疾病因素造成的输卵管堵塞。4.腹腔手术、反复通液也会波及输卵管导致炎症扩散，造成的输卵管堵塞。5.流产后休息太少导致不孕，饮咖啡过多，久坐的女性导致的。