肛周囊肿早期保守治疗，可以药物治疗，并辅以中药清热解毒，理疗等方法辅助，也可以做手术治疗，另外也在饮食上要多加注意，多吃一些清淡富含纤维比较高的食物，多注意运动。
肛周囊肿检查B超和MRI检查。多为椭圆形，均匀的低点状回声且内部无血流信号，多数伴后方回声增强，伴发感染时则回声不均匀，呈现无回声或增强回声，而发生于睾丸部分的表皮样囊肿有典型的“洋葱皮”样、“漩涡”样、“螺纹征”表现。
肛周脓肿，可以到普通外科，周脓肿这种疾病诊断明确，应该及时的选择手术治疗，进行切开引流，同时也要留取细菌学的依据，指导抗感染治疗。术中要仔细的探查，清除脓汁。确切的找到内口，进行切开。手术以后要定期的进行换药，叮嘱病人增加营养，促进恢复。
肛门视诊：是对肛门周围皮肤有无增厚、红肿、血性、脓性分泌物、皮疹及瘘管等方面进行视诊。肛门指检：肛门指检就是用一个手指头伸进病人的肛门，以检查疾病的一种简便易行却非常重要的临床检查方法。准确的直肠指检，大致可以确定距肛缘7～10cm的肛门、直肠有无病变和病变的性质。便常规检查：可以了解消化道有无细菌、病毒及寄生虫感染，及早发现胃肠炎、肝病，还可作为消化道肿瘤的诊断筛查。
触摸法，探针检查、注入染色剂、灌注双氧水。介入法低位切开高位乳胶管引流法双氧水灌注法，双氧水灌注法适应各种瘘、尤其是高位复杂的。通过显示的数据就可以检查出患者的情况。
肛周脓肿可以通过彩超、血常规、CT还有一些症状可以确诊需要手术引流可以痊愈周脓肿的诊断比较简单，一般根据病人的症状体征就能确诊，也可以辅助彩超检查，药物治疗可以控制症状，但是容易反复发作，手术治疗是治的方法。