肛瘘手术治疗的费用，在不同级别的医院治疗，费用是有所差别。通常可以分为以下几个标准。如果在省级医院住院治疗，治疗总费用应该在10000-12000元之间。如果在市级医院住院进行手术治疗，治疗费用应该是在7000-8000元之间。
患有肛瘘，药物治疗的效果不是很好，尽量还是手术治疗，可以选择三级以上医院进行手术治疗，术后护理很快就会恢复，通常多喝水，多吃蔬菜水果。少吃辛辣食物，尽量保持大便通畅，防止便秘，不抽烟不喝酒，不熬夜，工作和休息规则。
肛瘘的手术价格要根据肛瘘复杂程度，高位肛瘘还是低位肛瘘来确定，费用在4000元-20000万左右。
对于低肛瘘，如果患者选择门诊手术和局部麻醉，费用要低得多，如果是单纯的肛瘘，二级医院的手术费用约4000元，三级医院的手术费用约为8000元。如果是复杂的肛瘘，二级医院的费用在6000元以上，三级医院的费用在10000元以上。如果是高复杂性肛瘘，费用会更高，可能在2万元左右。包括术前相关检查费用、手术费用、床位费用、护理费用、换药费用等。
得了肛瘘，必须进行手术治疗，由于是肛门的解剖结构发生改变，口服或外用药物治疗，不能够改变解剖结构，所以必须得手术切除瘘管，开放伤口，让手术的伤口自己慢慢的长好。有复杂肛瘘，或者是经过肛门括约肌的肛瘘，还需要做挂线手术。术后需要用无菌纱布填塞，起到压迫止血的效果。术后需要坚持换药治疗，根据创面的大小换药的时间不一定，一般选择肛门洗剂、膏纱条等药物进行换药处理，术后还需要药物进行消炎治疗。
10-20天。个肛痿经过手术之后所涉及到的面积范围有所不同，所以手术切口要愈合的时间性也会波动，既而会直接使痊愈时间也会存在不同。所以说，肛瘘手术后一般可在10-20天左右能痊愈，而具体是需要多少天就会因人而异。