肛周脓肿的轻重，分型决定了手术的方式，比较深的脓肿可能采用切开引流的方式，主要是保护肛门功能，以后大部分形成肛瘘需要二次处理，一般的脓肿采用一次切除，术后恢复期较长。
肛周脓肿需要手术治疗方法确切术中情况来选择肛周脓肿手术或肛周脓肿切开引流术，术后抗炎，可以到正规医院做引流手术，治疗脓肿手术费用600元左右，术后左右保持创面清洁干燥，避免辛辣温热的刺激食物。
单纯的、小的肛周脓肿手术，创面小、恢复快，住院7-10天即可出院，总费用在12000元左右；对于复发或创面较大的，术后需要挂线，包括紧线或松线治疗，部分感染较重，还须延长抗生素的使用、延长冲洗时间，此类的费用能达到2万元以上；某些重症创面换药要求严格，需使用减少创面感染的敷料，其费用更高。因此肛周出现疼痛或不适，须及时就诊。
婴儿肛周脓肿的治疗方式如下：
小儿肛周脓肿的治疗要看病情的严重程度，进行针对性治疗。首先，可以用抗生素来控制感染，在家里用温水坐浴。如果形成脓肿，需要切开引流。开始会出现皮肤红肿硬结，然后会变软，会有波动感，还有一些孩子会出现高烧、呕吐等症状。肛周感染是由肛周软组织引起的急性化脓性感染导致的，这是一种很特殊的疾病，一般是由肛门部位的皮炎、疖肿、粗糙的尿布划破肛周组织，或者是感染引起的周围脓肿。
肛周脓肿是慢性化脓性组织炎症，主要症状是剧烈疼痛，并逐渐加重。脓肿破裂后疼痛会暂时减轻，肛周脓肿一般都是要进行手术治疗的，否则比较难痊愈。可选择正规的医院去治疗，手术费用应该也不贵，当然，医院级别不一样，收费的标准也是不一样的。