肛周脓肿的治疗应根据不同情况选取不同的方法，中药治疗方法包括：在未成脓阶段，以消为主，通过清热解毒、软坚散结的药物使脓肿尽快消散；在成脓阶段，通过托的方法，包括补托法、透托法，使脓液尽早排出、排净，达到目的；在后期阶段，以补为主，通过补益气血，促进局部生肌长肉，尽早愈合。
引起肛周脓肿的病因较多，主要原因有以下几个方面：1、感染性因素：感染是引起本病的主要原因。2、医源性因素：临床上属医源性引起的肛门直肠周围脓肿也不少见。3、手术后因素：临床上亦可见到肛门直肠手术引起感染，而形成的直肠周围脓肿。4、其它：直肠内异物损伤后感染，放线菌病，直肠憩室炎感染，肛管直肠癌破溃或波及深部的感染，及身体虚弱，抵抗力低下。
任由肛瘘发展，会对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。肛瘘的多发会形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有癌变的可能。肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
有时候压力大或者过度紧张或者在饮食上喝酒、吃辛辣的东西会感觉肛门周围突然的肿痛。所以肛周脓肿有很多诱因，与引起体内湿热上火的因素关系较大，所以发病是年轻的男性居多。
周脓肿是一种感染性疾病，主要是由于肛腺反复感染所导致的，需要系统的进行治疗。轻微的肛周脓肿只是临床症状比较轻，疼痛没有那么严重，但是反复发作也会诱发感染加重，导致肛瘘的形成。所以对于轻微的肛周脓肿，诊断明确之后也应该及时进行手术治疗，确切的找到内口，必要时要进行切开。