灰指甲磨薄要用温水或冰醋酸对指甲进行抛光，灰色指甲是由真菌感染引起的，如果有脚气也需要同时治疗，也可以到正规医院皮肤科就诊，在医生指导下进行治疗。注意卫生，注意鞋袜的卫生消毒。
对于灰指甲主要可以从饮食方面来预防治疗，药物治疗也是主要的治疗方法，灰指甲的传统治疗方法是在用药前用小刀刮削松脆的病甲或将病甲削薄，然后涂抹药物进行医治，若长时间不见好转要及时就医。
灰指甲的检查主要是真菌的检查，通常会取病甲的甲表面、甲下碎屑、甲组织进行真菌镜检，看是否存在菌丝，以确诊灰指甲；为了确定致病菌种则需要将这些甲组织进行培养，确定菌种；另外如果怀疑其他疾病，比如黑色素细胞瘤引起的甲病变，则可以做其他检查，例如B超等。
直接镜检。可剪除病甲，浸泡于20%KOH中，待甲板部位变软之后，将其压碎进行镜检，可发现甲板中存在有真菌菌丝孢子。该项检查仅能确定存在感染，但是对于具体的真菌感染类型无法确诊。因此若是想要对真菌类型进行具体的分析确诊，还需要进行更为详细的检查，常见如病理性检查等。
灰指甲检查通常不用抽血化验。灰指甲医学上称甲癣，致病菌主要是红色毛癣菌，其次是絮状表皮菌多由于浴池，毛巾等在公共场所间接接触传染，先从一个甲面开始，逐渐发展其他甲面与甲下，临床表现为甲板增厚，甲面粗糙不平，中空或与甲床分离，即可合并甲沟炎。