主要是由于脚气或者手癣传染导致目前主要使用药物进行治疗，可以使用特比萘芬乳膏外用治疗，应该坚持治疗一个阶段局部的症状，消失后再巩固治疗1~2周的时间基本可以治疗。另外平时也可以使用花椒水泡脚，也能够有效的预防和治疗真菌感染，还应该穿疏松透气的鞋子，这样有利于脚的健康。此病会导致传染，一旦确诊需要注意卫生，切断传染源，用过的物品必须严密消毒，需要通过中西药结合的方法，配合刮甲以及封包的方法。
外用药物可以有一定的疗效，但疗程长，要有长期坚持治疗的耐心，手指甲有灰指甲一般外用药物最少三个月。想治好灰指甲可以采用外用加内服的办法，用药一周休息三周为一个疗程。一般需要3个疗程。用药期间密切监测肝功能。
灰指甲通常指甲癣。一般情况下，不存在“最好”的说法，甲癣可以通过使用药物、日常护理等方式来治，具体内容如下：
1.使用药物：如果患者有甲癣，应及时就诊，遵医嘱使用盐酸特比萘芬乳膏、伊曲康唑颗粒等药物进行治疗，必要时可以拔甲进行治疗。
2.日常护理：如果患者患有甲癣，应养良好的卫生习惯，要注意保持甲部清洁、干燥，要及时更换、清洗鞋袜，尽量避免穿着他人的鞋袜，以免出现传染。
孕妇可以治疗灰指甲。
灰指甲是一种常见的真菌性疾病。在临床中如果孕妇发生了灰指甲，也是可以进行治疗的。但由于患者处在一个比较特殊的时期，在灰指甲治疗期间，往往只建议其应用外涂的抗真菌药物，并不建议患者应用口服的抗真菌药物。最常用的就是阿莫罗芬、碘酊等来进行外涂的治疗。如果要口服药物来进行治疗，应在医生的指导下进行治疗，如果有不良情况应及时前往医院进行检查。
灰指甲的疗法要用抗真菌药物，因为指甲的结构非常特殊，一般的外用药渗透能力不够，所以灰指甲现在主要是以吃一些药物为主，随着新长出来的指甲会变好，随着好的指甲逐渐往前生长，慢慢从过去的坏指甲就变成完全好的指甲。