治疗毛囊炎的方法就是内外法同用。外用抗生素涂抹患处，内服中药调理体质。饮食上要注意少吃酒类及酸、辣等刺激性食物，反复发作者平时应少吃油腻之物，多食蔬菜、水果，增加维生素，保持大便畅通。同时注意个人清洁卫生，加强体育锻炼，增强抗病能力。
毛囊炎吃中药、西药都管用。可以针对性的使用抑制葡萄球菌的药物，比如可以口服四环素、盐酸米诺环素。中药比如一清胶囊、牛黄解毒片、清热散结胶囊。还可以加上防风通圣散、丹参酮胶囊，都有很好的抑制葡萄球菌的作用。
可以采用物理的疗法，像紫外光的照射红蓝光的照射等，另外可以采用手术治疗特别大破溃的时候，可以采用切开引流的方式。另外需要注意的一点是在危险三角的毛囊炎，尽量避免挤压轻微的毛囊炎，散在数量比较少的毛囊炎是可以自愈的。
通常来讲，毛囊炎是因为火热之邪瘀阻所致，所以可以采用活血祛瘀、清热消肿等药物来进行治疗。可以口服清热化毒丸和二丁胶囊。此外，肺主皮毛，毛囊炎也可能是肺热引起的，可以在大椎、肺痨等位置进行放血拔罐。此外，对于毛囊炎，可以使用一些神农草本药膏来进行改善，有清热解毒的效果。另外，要注意日常减少饮酒，避免食用辛辣食品。
毛囊炎用盐酸布替萘芬乳膏、硝酸舍他康唑乳膏等软膏进行治疗，同时配合服用伊曲康唑胶囊等药最有效。
毛囊炎通常是毛囊部位出现炎症而引起的皮肤病，通常跟体内细菌感染以及真菌感染有很大的关系，而通过涂抹药膏以及服用药物，通常可以达到治疗毛囊炎的效果，使头皮部位的肌肤变得光滑。
在日常生活中要避免吃油腻以及辛辣的食物，同时也要注意个人卫生。
