引起卵巢早衰的原因可能与遗传、免疫因素、不良生活习惯、感染、卵巢手术、特发性卵巢早衰和垂体功能异常等有关。可能跟压力大，劳累，休息不好，饮食等方面有关，卵巢早衰对于女性的危害是很大的。
卵巢早衰多由不良生活方式：过度肥胖、长期抽烟酗酒、生活压力大，才卵巢早衰。有卵巢肿瘤及卵巢手术病史，因医源性损害使卵巢正常组织变少，卵巢早衰。或者有卵巢肿瘤及卵巢手术病史，因医源性损害使卵巢正常组织变少，卵巢早衰。也有未发现任何病因的卵巢早衰。
可能是心理因素引起的。不良的情绪可以导致女性体内的免疫活性物质分泌减少。强烈的情绪波动或者突然有巨大的精神刺激，可以导致中枢神经系统改变，从而就会导致月经失调，最终就会引起卵巢早衰。
不良习惯也会引起卵巢早衰。有关调查结果表明：每周吃两到三次鱼、虾的妇女，绝经年龄较晚。常年喝牛奶的妇女，量较多、时间越长，绝经越晚。从不锻炼身体的妇女，绝经年龄早；收到被动吸烟侵害越多、时间越长、绝经越早。减肥过度的女人也容易卵巢早衰，因为相当部分的雌激素保存在脂肪组织中。
因为先天性生殖细胞数少，卵泡闭锁加速，染色体异常，也就是指家族遗传史。此外，化疗、感染等导致促性腺激素分泌缺陷或促性腺激素受体或受体后缺陷，放射线照射都可破坏卵巢，导致暂时的或永久的闭经。
卵巢早衰和自身身体素质、特殊药物作用、以及不良嗜好等有关系的，比如化疗药物、抽烟等，卵巢雌激素分泌降低也会引起。可以去医院化验一个激素六项，检查病因对症治疗，也可以配合一点中药调理。