卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
预防卵巢囊肿最好的办法就是要调整好自己的生活作息和饮食习惯，少吃生冷、油腻性的食物，积极的治疗女性的妇科炎症，避免使用一些激素类的药物，导致体内激素分泌异常。
卵巢囊肿是可以通过手术取出囊肿的。平时要多注意情绪的调节，保持心情舒畅，多休息，多吃些清淡的，少吃辛辣刺，激性过大的食物，多吃水果，多喝点热水。具体需要遵训医嘱。
患者想要有效预防卵巢囊肿的复发，要注意改变生活方式，不可以经常吃刺激性的食物，比如葱、辣椒等，这些食物可能会导致身体激素分泌水平紊乱，从而导致卵巢囊肿。
患者注意尽量避免使用激素类的药物，可能会导致卵巢囊肿，要尽量采取科学性的生活方式，平时注意心情，保持良好的心态，还要注意从压力方面进行调理，还要养成良好的生活习惯。
卵巢囊肿的预防方法：女性朋友在月经期要注意卫生，以及在月经期和产后妇女严禁房事，要保持外阴及阴道的清洁；预防卵巢囊肿，女性要注意日常的饮食，烟和酒是极酸的酸性物质，长期吸烟喝酒的人，极易导致酸性体质；保持良好的情绪，适当缓解压力，劳逸结合，不要过度疲劳。