如果直径小于五公分，可给予消炎类药物进行治疗，药物治疗不好或者是直径大于五公分，则需要进行手术处理，然后再辅以药物治疗。手术治疗的方式有传统的开腹手术和现在的腹腔镜微创手术，开腹手术创伤大，出血多，病人恢复慢，而腹腔镜手术创伤小，出血少，恢复快。
如果现在有卵巢囊肿的情况，这样对正常的受孕也有一定的影响的，现在可以在当地医生指导下，服用药物进行治疗。在用药治疗期间一定要注意休息，不要过度劳累，加强营养，不要食用生冷辛辣刺激性的食物。
卵巢囊肿女性生殖器官的常见肿瘤，可发生双侧或一侧卵巢。卵巢囊肿可能会导致白带异常、月经失调、身体多毛、容颜早衰等症状，如果囊肿破裂可能还会危及生命，因此卵巢囊肿对女性健康危害很大。如果囊肿小于五厘米，一般可采取服用中药治疗，可遵医嘱服用金鸡胶囊、桂枝茯苓胶囊、止痛化癥胶囊等药物进行治疗，注意定期体检；如果大于五厘米，则需要手术治疗，一般可考虑选择宫腹腔镜微创手术进行治疗。
消除卵巢囊肿适宜的食物有：牛奶、鸡蛋、瘦肉、鲫鱼等，菠菜、山药、香菇、油菜、白菜等，苹果、鸭梨、大枣、花生等；不易吃螃蟹、带鱼、青鱼、鹅肉、狗肉、羊肉、葱、姜、蒜、辣椒、桂圆、橘子等，同时要忌烟忌酒。
卵巢囊肿是可以治好的，但有复发的可能性，如果小于5厘米，考虑生理性囊肿，可以选择观察，如果大于6cm，应该考虑进行微创手术切除，同时配合中药调理，防止复发与转移的可能，期间加强营养，放松情绪，定期复查，避免熬夜。
