宫内膜异位症的治疗方案，年龄和生育情况而有所不同。如病情较重，或表现为重的痛经，或盆腔检查发现有肯定的内膜异位结节，就必须采取药物或手术治疗。采用药物来对抗或抑制卵巢的周期性内分泌刺激。最初是用睾丸酮类的雄性激素，因副作用较大，而且效力亦不够强，已逐渐摒弃不用。后来则逐渐发展成为假孕疗法及假绝经疗法。
子宫内膜异位症术后备孕可以试孕或者是去生殖中心接受辅助生殖技术的助孕。保守性手术的复发率可以高达50%，甚至更多，复发后体内又会出现原有的紊乱。凡有生育要求的患者，要尽量争取在停药半年内怀孕，因为停药后随着月经的复潮，疾病往往还是会复发。所以子宫内膜异位症患者如何备孕需要由专业的医生根据病情、术中所见、生育指数评分给出个体化的建议。
子宫内膜异位可以采取以下方式进行锻炼。
1、术前：子宫内膜异位病有发生破裂的危险，如果做的比较大，有些病人可能会发生翻转。所以，大的囊，要尽量不要做太激烈的运动，但是一般的游泳、慢跑是可以的。
2、手术后的一个多月，也就是在恢复的这段时间里，尽量不要做太大的运动，在恢复期之后不要做运动，可以参加跑步、跳、游泳等各种运动。
月经干净后可以上医院就诊检查。妊娠和哺乳也是治疗子宫内膜异位症的有效手段，既是治疗的目的也是治疗过程。因为妊娠抑制卵巢功能而闭经异位内膜停止发展。子宫内膜异位症是指具有生长功能的子宫内膜，在子宫腔以外的部位着床，并且规律性脱落。好发于卵巢，直肠陷窝和宫骶韧带。
需要看的病情轻重，请仔细检查后配合医院积极治疗，因本病是受激素影响而发生的疾病，故主要采用激素治疗，对激素治疗无效或病情较重时用手术治疗。这些方法虽有一定的治疗效果，但复发率较高，远期疗效尚不满意。
子宫内膜异位症是指子宫内膜生长在子宫以外的其他位置，西药治疗通常包括促性腺激素释放激素激动剂，可令异位子宫内膜组织萎缩，从而达到治疗目的。手术治疗切除内膜异位病灶，有的甚至切除子宫、卵巢；适用于药物无效的重症生病的人。