引起继发性脓性腹膜炎的病因有：①腹内脏器穿孔以急性阑尾炎穿孔最为常见，其次是胃十二批肠溃疡穿孔，其他还有胃癌结肠癌穿孔、胆囊穿孔、炎症性肠病和伤寒溃疡穿孔等；②肠道和腹内脏器炎症如阑尾炎、憩室炎、坏死性肠炎Chron病、胆囊炎、胰腺炎和女性生殖器官的化脓性炎症等；③腹部钝性或穿透性损伤致腹内脏器破裂或穿孔；④手术后腹腔污染或吻合瘘；⑤机械性绞窄性肠梗阻和血运性肠梗阻如肠扭转、肠套叠、闭襻性肠梗阻肠坏死肠系膜血管栓塞或血栓形成等；⑥医源性损伤，如结肠镜检查时结肠穿孔、肝活检或经皮肝穿刺胆管造影的胆汁瘘腹腔穿刺后小肠损伤等。
胃肠道中的内源性细胞常是继发性腹膜炎的致病菌最常见的为在肠杆菌，其次为肠球菌、粪链球菌变形杆菌、绿脓杆菌等。对厌氧菌的研究表明末前几天回肠内需氧菌和厌氧菌的数目大致相等，而结肠内两者之比超过3000∶1。故细胞性腹膜炎常是多细菌性混合感染
原发性腹膜炎是指腹腔内并无明显的原发感染病灶病原体经血行、淋巴或经肠壁、女性生殖系进入腹腔而引起的腹膜炎远较糨发性腹膜炎少见。常发生于：①婴儿和儿童；②患肾病综合征儿童；③肝硬化腹水病人④免疫功能抑制的病人，如肾移植或用皮质类固醇治疗的血液病病人；⑤全身性红斑狼疮病人
儿童期原发性腹膜炎的主要致病菌是肺炎球菌和链球菌可能经呼吸道或泌尿道侵入，经血行播散到达腹膜腔。在成人则多为肠道的内源性细菌所致经女性生殖道上行性感染的细菌种类较多。